《Journal of Intellectual Disability Research》:Expanding the Clinical Spectrum of DHX30-Related Neurodevelopmental Disorder: A Case Report and a Scoping Review
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背景:全外显子测序(WES)提高了神经发育障碍(NDDs)的诊断率,同时也带来了新变异解读方面的挑战。DHX30相关神经发育障碍(DHX30-NDD)是一种近期描述的疾病,其表型谱系仍在不断演化中。
目的:通过将基于病例的WES解读与范围综
摘要翻译:
背景:全外显子测序(WES)提高了神经发育障碍(NDDs)的诊断率,同时也带来了新变异解读方面的挑战。DHX30相关神经发育障碍(DHX30-NDD)是一种近期描述的疾病,其表型谱系仍在不断演化中。
目的:通过将基于病例的WES解读与范围综述相结合,扩展对DHX30-NDD基因型-表型谱系的理解。
方法:研究人员对一例全面性发育迟缓(GDD)先证者进行了全面的遗传学分析(核型分析、微阵列分析、WES)。对PubMed/MEDLINE、Scopus和Google Scholar从建库至2026年4月的系统文献检索,确定了10篇包含51例DHX30-NDD个体的出版物。提取临床和遗传学数据以刻画基因型-表型谱系。
结果:先证者表现为GDD和右侧小耳畸形,携带一个新生杂合致病变异DHX30错义变异(c.1478G>A; p.Arg493His),确诊为DHX30-NDD。据研究人员所知,这是首例报道的DHX30-NDD合并小耳畸形的个体。范围综述证实DHX30变异主要为新生变异,且两性均可受累(22例男性;29例女性)。标志性表现包括运动发育迟缓(50/51;98.0%)、GDD/ID(48/49;98.0%)、肌张力低下(48/51;94.1%)、喂养困难(38/51;74.5%)、共济失调(17/23;73.9%)、脑影像学异常(36/49;73.5%)和表达性语言缺失(35/48;72.9%)。手指异常(31/51;60.8%)、眼部异常(28/51;54.9%)、孤独症样行为(24/44;54.5%)、睡眠障碍(26/51;51.0%)、关节过度活动(25/51;49.0%)、小头畸形(23/51;45.1%)和耳部异常(22/51;43.1%)也较为常见。
结论:本研究可能扩展了DHX30-NDD的表型谱系,强调了WES在诊断GDD中的临床实用性,并突出了持续进行WES重分析对于不断演化的变异解读的重要性。
论文解读:
DHX30相关神经发育障碍(DHX30-NDD)是一种近年来通过全外显子测序(WES)逐渐被认识的遗传性疾病,其核心表型包括全面性发育迟缓(GDD)、智力障碍(ID)、肌张力低下、运动发育迟缓和语言缺失。尽管诊断性测序提示该病的临床谱系可能比最初描述的更为广泛,但关于耳部和手指异常的证据仍多为零散个案,尚未得到系统性验证。确定这些特征是否构成一致的表型扩展,对于准确的综合征识别和临床管理至关重要。为此,研究人员开展了一项基于病例的WES解读与范围综述相结合的研究,旨在扩展DHX30-NDD的基因型-表型谱系,评估WES在GDD诊断中的实用性,并阐述继发性发现(SFs)的实践管理。
研究人员报告了一例7岁10个月大的泰国男孩,足月出生,出生体重3.65 kg,出生时发现孤立性右侧3级小耳畸形(无耳道闭锁),16个月时发现悬雍垂裂和黏膜下腭裂,存在全面性发育迟缓、躯干肌张力低下、左侧为主的肌张力增高(25个月时缓解)、左皮质拇指和降落伞反射缺失等表现。脑磁共振成像(MRI)显示双侧枕叶脑室周围白质T2/FLAIR高信号伴轻度脑室扩张,符合远期白质损伤。该患者同时存在小颌畸形、手指渐尖样改变、慢性便秘,并在2岁后出现体重持续增加至第90百分位、身高保持在10百分位的肥胖趋势。家族史无神经发育障碍。研究人员依次进行了核型分析(正常46,XY)、甲状腺功能检查(正常)、Prader-Willi综合征多重甲基化特异性PCR(正常)、染色体微阵列分析(CMA)和WES。CMA仅发现5q14.1–5q15区域16.23 Mb的纯合性区域(ROH),提示可能为单亲二体(UPD),但未检出致病性拷贝数变异;WES检出DHX30基因新生杂合错义变异c.1478G>A(p.Arg493His),依据ACMG/AMP指南(PS2、PS3、PM2_Supporting)被归类为致病性变异,确诊为DHX30-NDD。此外还检出MYBPC3基因杂合25 bp缺失(c.3628-41_3628-17del)作为继发性发现,该变异遗传自父亲,与肥厚型心肌病相关,但与本患者的神经发育表型无关。
研究人员通过范围综述,检索了PubMed/MEDLINE、Scopus和Google Scholar自建库至2026年4月的文献,最终纳入10篇出版物共51例DHX30-NDD个体(含1例胎儿病例),加上本病例共52例。主要关键技术方法包括:对先证者进行核型分析、CMA(CytoScan 750K平台)和WES(SureSelect Human All Exon V6+UTR试剂盒,Illumina NovaSeq 6000平台,平均深度45.2×,93.7%目标碱基≥10×);通过Sanger测序对家系成员进行变异验证和分离分析;按照PRISMA-ScR清单进行范围综述,由两名研究人员独立筛选文献、提取数据,并使用REDCap进行数据管理。样本队列来源于已发表的10篇文献中的51例患者以及本研究的1例新病例。
研究结果显示:大多数DHX30变异为新生错义变异(43/47;91.5%),且集中在解旋酶核心区域(41/47;87.2%),尤其是Motif VI功能域(27/47;57.4%)。男女比例相近(22:29)。早期临床表现包括肌张力低下(48/51;94.1%)、喂养困难(38/51;74.5%)和运动发育迟缓(50/51;98.0%)。几乎所有个体均有GDD/ID(48/49;98.0%),多数缺乏表达性语言(35/48;72.9%),约半数能独立行走(23/48;47.9%),其中常伴共济失调步态(17/23;73.9%)或其他运动障碍。合并症常见,包括手指异常(主要为渐尖指)(31/51;60.8%)、孤独症样行为(24/44;54.5%)、睡眠障碍(26/51;51.0%)、关节过度活动(25/51;49.0%)和小头畸形(23/51;45.1%),这些特征在解旋酶核心区域变异亚组中更为普遍。相反,斜视(22/51;43.1%)和耳廓结构或位置异常(18/51;35.3%)在非解旋酶核心区域变异亚组中更常见。特定的耳廓畸形包括后旋耳、低置耳、对耳轮脚突出、对耳轮过度折叠、大耳畸形和耳垂上翘。神经系统表现同样显著:16/51(31.4%)有不同半规和发病年龄的癫痫发作,9/51(17.6%)有发育退化。49例接受脑MRI检查的个体中36例(73.5%)存在异常,最常见的是大脑皮层和弥漫性体积丢失、白质减少和髓鞘形成障碍。携带非解旋酶核心区域DHX30变异的个体临床表型通常较轻。
在讨论部分,研究人员指出DHX30基因位于3p21.31,编码RNA依赖性RNA解旋酶,通过ATP水解解旋RNA二级结构,对线粒体核糖体组装至关重要,并在应激颗粒(SG)组装中发挥保守作用。严重错义变异(尤其位于解旋酶核心基序(HCM)内)通过损害ATP酶和解旋酶活性,并以毒性功能获得效应诱导SG过度形成,导致全局翻译受损,表现为严重的神经发育障碍(最严重的称为NEDMIAL);而功能丧失型变异或嵌合HCM错义变异则呈现较轻的临床病程。本病例的表型与HCM致病性错义变异引起的核心表型相符,但患者较既往报道的相同变异病例更早实现独立行走(25个月对30–48个月),并能跑步,同时伴有食欲亢进和独特的小耳畸形。研究人员提出,DHX30功能障碍导致线粒体翻译缺陷,进而影响神经嵴细胞的生物能量供应,可能干扰第一和第二咽弓的发育,从而与患者的小耳畸形、黏膜下腭裂和小颌畸形并存相符合,但这一假说仍需功能学验证。关于小耳畸形究竟是真实表型扩展还是偶然合并,单例观察无法确定因果关系,应谨慎解读。
研究结论部分翻译为:全面的基因组检测是评估GDD/ID不可或缺的手段。本研究细化了DHX30-NDD的表型,有助于早期识别。此外,验证WES作为一线工具有助于解决诊断长跑,同时也带来了继发性发现等复杂性。这强调了多学科管理和全面遗传咨询的迫切需要,以确保以家庭为中心的负责任照护。3级小耳畸形这一新观察应被视为表型的临时扩展,需在更多病例中得到确认。