简要摘要
日本沼虾（Macrobrachium nipponense）是中国重要的淡水养殖物种。然而，分布于珠江流域各地的野生群体的遗传特征仍知之甚少。本研究从珠江流域14个地点采集了野生M. nipponense群体，并对线粒体DNA序列进行了分析，以研究群体间的遗传多样性和分化情况。结果显示，珠江流域野生群体具有较高水平的遗传变异，且来自不同地理区域的群体之间表现出明显的遗传分化。部分群体显示出独特的遗传特征，可能作为保护和育种中有价值的遗传资源。本研究为野生M. nipponense群体的保护和可持续利用提供了重要信息，也可能为今后培育改良养殖品种做出贡献。
摘要
本研究基于线粒体DNA（mtDNA）D-loop序列，评估了珠江流域野生M. nipponense群体的遗传多样性和群体结构。从西江、北江及珠江三角洲共采集了14个野生群体，利用单倍型分析、分子方差分析（AMOVA）、两两FST值和主成分分析（PCA）评估了遗传多样性和群体分化。共鉴定出351个可变位点。总体的单倍型多样性（h）和核苷酸多样性（π）分别为0.947和0.03665，表明珠江流域范围内具有较高水平的遗传多样性。群体间检测到显著的遗传分化（FST = 0.3785，p值 < 0.001），其中37.85%的遗传变异发生在群体之间。主成分分析揭示了群体间不同的遗传关系，支持了珠江流域内存在群体遗传结构。来自天峨县、西林县、大化瑶族自治县及其他西江上游支流的群体，与来自肇庆市、贵港市、广州市以及西江中下游和珠江口的群体相比，表现出不同的遗传特征。在14个群体中，来自肇庆市、贵港市和广州市的群体表现出相对较高的遗传多样性和独特的遗传特征。这些发现表明，珠江流域复杂的水文结构和历史连通性对观察到的群体遗传结构有贡献。本研究中鉴定出的遗传多样性丰富的群体是M. nipponense保护和选育中有价值的野生种质资源。
