《Human Genetics and Genomics Advances》：Genetic dissection of cardiac iron regulation using transcriptome network analysis and systems genetics in BXD mice
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摘要心脏铁稳态对于心肌能量代谢和收缩功能至关重要，但控制心脏内铁水平的遗传和分子机制仍知之甚少。我们采用系统遗传学方法来解析心脏铁稳态的转录调控。心肌铁水平在 BXD 品系间存在显著差异（40 – 112 μg/g），并受可遗传的遗传控制（H2 = 0.38）。在 BXD 群
摘要
心脏铁稳态对于心肌能量代谢和收缩功能至关重要，但控制心脏内铁水平的遗传和分子机制仍知之甚少。我们采用系统遗传学方法来解析心脏铁稳态的转录调控。心肌铁水平在 BXD 品系间存在显著差异（40 – 112 μg/g），并受可遗传的遗传控制（H2 = 0.38）。在 BXD 群体中，心脏铁水平升高与心室质量减少、心室早搏增多以及房室传导延长相关。对 BXD 心脏转录组进行的加权基因共表达网络分析鉴定出一个共表达模块，该模块在幼年和老年 BXD 小鼠中均与心脏铁水平呈显著负相关，并富集于与代谢调节、cAMP 信号、昼夜节律授时和心血管生理学相关的路径。该模块与经过整理的心脏铁基因集存在大量重叠，跨物种富集分析证实其在人类心肌病差异表达基因中的保守性（富集比 = 1.49；FDR = 0.0342）。对重叠模块铁基因（n = 38）第一主成分进行的数量性状位点（QTL）定位，并得到单基因定位的证实，在多个染色体上鉴定出 trans-eQTL 热点，表明 Fcho2、Gcc2 和 Rmdn1 可能是通过胞内铁转运的连续步骤起作用的候选上游调节因子。综上所述，这些发现建立了心脏铁基因调控的系统水平图谱，鉴定了候选遗传调节因子，并提供了一个分子框架，将铁相关转录网络的中断与心脏结构和电功能障碍联系起来，对铁相关心脏病具有启示意义。
Akhilesh K. Bajpai|Qingqing Gu|Rakesh Kumar|Xiangtang Li|Athena Starlard-Davenport|Wenjing Zhang|Enkhsaikhan Purevjav|Byron C. Jones|Qingyin Zheng|Dong Wang|Lu Lu
