综述:工程微生物生产 L-组氨酸及其功能衍生物的最新进展与挑战

《Food Bioscience》:Recent advances and challenges for engineered microbial production of L-histidine and its functional derivatives

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月12日 来源:Food Bioscience 6.2

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   摘要L-组氨酸是一种必需的生蛋白氨基酸,在制药、食品和饲料行业具有广泛的应用。同时,作为平台化合物,L-组氨酸可通往多种功能衍生物,包括L-肌肽、肌酸酞宁和组织胺。目前,这些化合物的生产主要依赖从天然组织中提取和化学合成,存在原料供应不稳定和环境问题等缺点。近年来,随着代谢工

  

摘要

L-组氨酸是一种必需的生蛋白氨基酸,在制药、食品和饲料行业具有广泛的应用。同时,作为平台化合物,L-组氨酸可通往多种功能衍生物,包括L-肌肽、肌酸酞宁和组织胺。目前,这些化合物的生产主要依赖从天然组织中提取和化学合成,存在原料供应不稳定和环境问题等缺点。近年来,随着代谢工程和合成生物学的发展,生物合成已成为L-组氨酸及其功能衍生物生产的一种有前景且可持续的替代方法。人们已经投入了大量努力来构建底盘菌株以生物合成这些化合物。本综述全面总结了L-组氨酸及其衍生物微生物生产的最新进展。详细介绍了这些化合物的生物合成途径,并重点强调了基于代谢工程和合成生物学提高其产量的策略。更重要的是,本文特别关注了限制微生物系统中高效生物合成L-组氨酸及其衍生物的持续挑战,包括碳通量分配不平衡、能量货币困境、有益靶基因未知、酶活性次优以及大规模生产的困难。同时,提出了可行的工程解决方案和未来的研究方向,以指导高性能微生物细胞工厂的开发,用于L-组氨酸及其高价值衍生物的生产。

引言

L-组氨酸是一种必需的蛋白原氨基酸,在制药、食品和饲料领域具有广泛应用(图1)。其全球需求持续增长,激发了开发高效微生物生产平台的强烈兴趣(Hole?ek, 2020)。1896年,Kossel和Hedin从鲑鱼精蛋白中首次同时分离出L-组氨酸(Vickery & Leavenworth, 1928)。L-组氨酸对人类和动物的生长和生理健康尤为必要(Kasaoka et al., 2004; Li et al., 2016)。根据WHO/FAO的推荐,由于婴幼儿自身合成不足,L-组氨酸的推荐每日膳食需求量为每公斤体重10毫克(Brosnan & Brosnan, 2020)。膳食补充L-组氨酸可以减轻疲劳、抗氧化并预防多种疾病,如高血压、炎症、肥胖和胰岛素抵抗(Hasegawa et al., 2011; Kasaoka et al., 2004; Petrova & Kanarek, 2020; Song et al., 2014; Tuttle et al., 2012)。L-组氨酸常作为金属蛋白的配体,这是因为其pKa约为6.0,能够在未质子化和质子化状态之间转换,这一特性凸显了其重要的生理作用(Kulis-Horn et al., 2014)。此外,富含L-组氨酸的短肽或小蛋白结构域在蛋白质纯化和固定化、先进药物递送系统和酶催化过程中具有多样化的应用。这种多功能性主要归因于其特定的分子亲和力和结合能力(Hèctor López-Laguna, 2022)。除了其直接功能外,L-组氨酸还是多种高价值功能衍生物的前体,包括L-肌肽、肌酸酞宁和组织胺。这些化合物参与各种生化及应激相关的细胞反应,如抗氧化防御、pH缓冲和免疫调节(Jedrejko et al., 2025; Kim et al., 2021; O'Mahony et al., 2011; Qiu et al., 2021)。鉴于上述重要功能,L-组氨酸及其衍生物是具有显著实际应用价值的高价值化合物。因此,开发具有商业吸引力且可行的L-组氨酸及其衍生生物活性化合物的生产路线变得日益紧迫。
L-组氨酸的主要生产方法包括从蛋白水解中提取、使用醛或酮作为底物通过Strecker反应进行化学合成,以及从可再生碳源进行微生物发酵(Mitsuhashi, 2014; Wu et al., 2020)。然而,从天然富含蛋白质的资源(如大豆、头发和血粉)中提取高度依赖于原料的供应。此外,化学合成主要产生外消旋混合物,存在有毒副产物和环境污染问题,这些共同限制了大规模制造和应用。类似地,L-组氨酸衍生物的生产目前也主要依赖于从天然组织中提取和化学合成,均面临产量、高成本和环境问题等挑战(Kang et al., 2025b; Liu et al., 2023b; Zhang et al., 2025c)。鉴于此现象的相关性和局限性,基于微生物的可持续发酵生产L-组氨酸及其衍生物是更受青睐的方法。
微生物细胞工厂因其在产品安全性和立体选择性方面的优势,成为L-组氨酸及其衍生物生物合成的理想平台。一些微生物底盘,如大肠杆菌(Zhu et al., 2022)、谷氨酸棒杆菌(Mizukami et al., 1994)、产单胞菌属的粘质产红杆菌(Masaki et al., 1987)和灰黄链霉菌(Vlasta et al., 1977),已成功用于从可再生资源生产L-组氨酸(表1)。在发酵工业早期,L-组氨酸生产菌株主要通过多轮组合突变与培养基筛选相结合开发(Kazumi & Kiyoshi, 1971; Vlasta et al., 1977)。然而,生长减缓和未定义的遗传背景是影响突变菌株大规模应用的主要因素。目前,快速增长的市场需求推动生产者进一步提高TRY(滴度、速率和产率)并降低生产成本(Nielsen & Keasling, 2016)。此外,对L-组氨酸衍生物的兴趣日益增加,将细胞工厂的开发范围从单一氨基酸生产扩展到多产品生物合成。值得注意的是,这些衍生物的生物合成途径共享L-组氨酸作为共同前体,凸显了工程化单一前体节点以合成多种下游产品的潜力。幸运的是,代谢工程和合成生物学的快速发展,加上丰富的基因工程工具,使得理性设计高性能底盘细胞以生物合成L-组氨酸及其衍生物越来越可行。
总之,基于微生物的L-组氨酸及其衍生物的可持续生产已成为绿色生物制造领域的重要研究优先事项。本文系统地总结了通过工程化大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌生产L-组氨酸及其衍生物的进展。特别描绘并讨论了L-组氨酸及其衍生物生物合成中的理性工程策略和合成生物学技术。此外,本文还评估了L-组氨酸及其衍生物生物合成中的挑战和潜在解决方案,为未来研究提供了有价值的见解。

章节摘要

L-组氨酸的生物合成途径

清楚了解L-组氨酸的生物合成网络对于微生物细胞工厂的理性工程至关重要。L-组氨酸的生物合成在微生物中是一个高度保守的过程,代表性宿主如大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌共享共同的底物和核心生物合成途径,但在基因组织和酶结构方面仍存在差异(Schwentner et al., 2019; Wu et al., 2020)。从代谢的角度来看,生物合成

消除反馈抑制

大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌中L-组氨酸的生物合成是一个复杂的过程,HisG受到L-组氨酸的严格调控,这极大地防止了其过量积累。为了克服这一限制,研究并报道了几种具有抗反馈抑制的HisG突变体(图4A)。Zhang等人鉴定了三重突变体N215K/L231F/T235A,该突变体释放了对L-组氨酸的反馈调控,其对于L-组氨酸的Ki值与野生型CgHisG相比增加了37倍。

L-组氨酸衍生功能化合物的生物合成

在回顾了生物合成途径、调控网络和增强L-组氨酸产量的工程策略之后,现在将焦点转向其下游衍生物。L-组氨酸是L-肌肽、肌酸酞宁和组织胺等生物活性化合物的重要前体,这些化合物具有独特的生理功能和显著的药用及营养补充价值(Jedrejko et al., 2025)。尽管L-组氨酸生产菌株为其生物合成提供了基础,

平衡细胞生长和产品合成

L-组氨酸及其衍生物的生物合成主要依赖于磷酸戊糖途径。相比之下,EMP途径用于生物量形成,代表了碳通量的主要竞争途径。然而,通过敲除pgi基因阻断EMP途径会导致细胞生长、葡萄糖消耗和菌株生产力的同时下降。因此,平衡细胞生长和产品合成是实现高TRY的挑战(图8A)。已研究多种解决方案来解决此问题(Liu

结论

L-组氨酸是一种营养必需的氨基酸,在制药、食品和饲料行业具有多方面的应用。因此,其应用不断扩展产生了增加的市场需求,推动了开发高效且经济的生产平台的兴趣。除了L-组氨酸外,其高价值衍生物(肌酸酞宁、L-肌肽和组织胺)因其强效的抗氧化、抗炎和

CRediT作者贡献声明

Jiajia You: 软件。Xuewei Pan: 方法论。Minglong Shao: 方法论。Fengyu Yang: 撰写 – 原稿,可视化,方法论,调查。Yaxin Liao: 调查。Zhina Qiao: 可视化。Yanan Li: 可视化。Zhiming Rao: 撰写 – 审阅与编辑,监督,方法论,资金获取。

未引用参考文献

Stephan Binder et al., 2001.

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的财务利益或个人关系可能会影响本文中报道的工作。

数据可用性

本文未使用数据。

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的财务利益或个人关系可能会影响本文中报道的工作。

致谢

本工作由江苏省前沿研发项目(BF2024012)、呼和浩特"揭榜挂帅"重大科技项目(2023-unveiling and commanding-He-1)、国家自然科学基金(32471530)、江苏省基础研究计划以及江苏省合成生物重点实验室(基金号 BK20233003)以及江南大学食品科学与工程国家关键实验室研究项目支持。
Fengyu Yang|Yaxin Liao|Zhina Qiao|Yanan Li|Jiajia You|Xuewei Pan|Minglong Shao|Zhiming Rao
教育部工业生物技术重点实验室,江南大学生物工程学院,江苏无锡 214122,中国
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