细绒棉（G. hirsutum L.）中Pto相互作用蛋白1（PTI1）基因家族的全基因组鉴定及在干旱和盐胁迫条件下的表达分析

《Genetic Resources and Crop Evolution》：Genome-wide identification and expression analysis of Pto-interacting1 (PTI1) gene family in G. hirsutum L. under drought and salt stresses

　　PTI1蛋白（Pto相互作用蛋白1）是一类受体样胞质激酶，在植物胁迫信号传导中发挥重要作用。本研究通过基因组范围的分析，鉴定和表征了陆地棉（*Gossypium hirsutum*）中的PTI1基因家族，并探讨其在非生物胁迫响应中的潜在作用。通过整合生物信息学方法，鉴定并分析了七个*GhPTI1*基因，包括理化性质预测、亚细胞定位、保守结构域和基序分析、系统发育和共线性分析、顺式作用元件鉴定、序列标志分析、miRNA靶标预测、RNA-seq表达谱分析以及qRT-PCR验证。GhPTI1蛋白在理化性质上存在差异，亚细胞定位预测显示四个蛋白位于细胞质，两个位于叶绿体，GhPTI1-4位于线粒体，提示可能存在功能分化并参与ROS信号传导。保守结构域和系统发育分析表明，PTI1蛋白高度保守，PTI1成员被分为三个不同的进化支。所有*GhPTI1*基因位于进化支II和III中，提示可能存在谱系特异性的基因多样化。启动子分析鉴定出大量激素和非生物胁迫响应顺式作用元件，同时在五个*GhPTI1*基因中预测了二十一个潜在的miRNA靶标位点。本研究在陆地棉中表明，该基因家族在进化上高度保守，并主要受纯化选择维持。表达谱分析显示，*GhPTI1-1*、*GhPTI1-2*、*GhPTI1-6*和*GhPTI1-7*在干旱和盐胁迫条件下的1 h、3 h、12 h和24 h均显著上调，表明这些基因是未来功能研究和抗逆性棉花品种培育的有前景候选基因。