综述：深远时间中的性别追溯：基于牙釉质蛋白的古蛋白质组学在考古学和古生物学中的应用

《Journal of Archaeological Science: Reports》：Tracing sex in deep time: Archaeological and palaeontological applications of amelogenin-based palaeoproteomics

　　

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  珐琅质蛋白质组学将染色体性别鉴定拓展至古DNA技术的极限之外。
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  釉原蛋白肽段使青少年及碎片化遗骸的性别鉴定成为可能。
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  近期工作流程改进了灵敏度、通量以及微创采样能力。
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  蛋白质组学性别鉴定结果与形态学、古DNA及考古学背景形成互补。

章节摘要

引言：性别在考古学与古生物学中的意义

性别鉴定是重建过去人类与动物群体的关键组成部分，所提供的信息涉及人口结构、死亡模式、生活史、性二态性、繁殖策略、迁移以及群体动态等多个方面。因此，可靠的性别鉴定可为从考古背景下的社会与丧葬组织到古生物学组合中生态与进化过程等一系列问题提供依据。然而，尽管其居于核心地位，

基于釉原蛋白的性别鉴定的分子基础

蛋白质组学性别鉴定所依赖的分子逻辑源自釉原蛋白的生物化学特性以及牙釉质独特的微结构环境。

方法论框架

基于釉原蛋白的性别鉴定依赖一个多步骤的分析框架，从采样策略到质谱采集，每个阶段都直接影响AMELX与AMELY衍生肽段的可信检测。尽管概念上较为直观，该方法仍需要仔细优化，尤其是在考古学背景下，标本往往稀有、脆弱或具有文化敏感性。与此同时，该领域正快速发展，近期研究引入了

在考古与古生物记录中的应用

利用牙釉质肽段推断染色体性别的能力正在拓展考古学、古人类学与古生物学研究的分析版图，使分子性别鉴定得以在常规方法可能受限的场景中实现。这一方法并未提出全新的研究问题，而是拓宽了可通过性别信息辅助解释的组合范围，将人口学、生态学与进化分析延伸至更深的

局限性与考量

尽管珐琅质蛋白质组学已大幅扩展了考古学与古生物学中的分析可能性，但基于釉原蛋白的性别鉴定的解释力取决于对一系列分析、样本相关、分类学及背景性限制的认识。

在分析层面，主要局限源于釉原蛋白标志物本身的非对称性（Froment 等，2020）。AMELX衍生肽段存在于所有个体中且通常丰度较高，

结语

基于釉原蛋白的珐琅质蛋白质组学已扩展了可研究染色体性别的考古学与古生物学背景范围，尤其在形态学评估受限或DNA保存较差的情况下更为突出。其意义不仅在于珐琅质蛋白质的时间持久性极佳，还在于提供了一种与染色体相关的额外生物学信息来源，可与人口学、生态学、进化学及

CRediT 作者贡献声明

Amanda Gutiérrez-Carbajal：撰写—审阅与编辑，撰写—初稿，概念构思。Guillermo Carrillo-Martin：调查研究，概念构思。Tomas Marques-Bonet：可视化，验证，监督，项目管理。

致谢

G.C.-M. 受西班牙加泰罗尼亚自治区大学与研究部研究与大学秘书处 AGAUR-FI 奖学金计划（2024 FI-1 00211）Joan Oró 项目及欧洲社会基金 Plus 资助。T.M.-B. 受欧盟地平线2020研究与创新计划下欧洲研究委员会（ERC）资助，资助协议编号864203，以及 PID2021-126004NB-100（MICIIN/FEDER，欧盟）。本工作属于 R+D+I

Amanda Gutiérrez-Carbajal|Guillermo Carrillo-Martin|Tomas Marques-Bonet