四种具有S-RBD结合活性和假病毒进入抑制活性的化合物的鉴定

《International Journal of Molecular Sciences》：Identification of Four Compounds with S-RBD-Binding and Pseudovirus Entry-Inhibitory Activity

　　**摘要**由SARS-CoV-2引起的COVID-19由于病毒演变和免疫逃逸，仍然是全球性的健康挑战。尽管当前疗法主要针对病毒进入和复制，但直接干扰刺突蛋白受体结合域（S-RBD）的药物仍然有限。本研究将虚拟筛选与生物学验证相结合，旨在筛选出能够干扰S-RBD功能的化合物。通过分子对接从定制的化合物库中对3014种化合物进行筛选。随后采用细胞热迁移实验、表面等离子体共振、免疫沉淀、免疫荧光以及针对2019-nCoV、Delta和Omicron假病毒的假病毒进入实验评估候选化合物的结合能力和功能活性。DOTAP氯化物（K_D = 49.94 μM）、头孢西丁己酯盐酸盐（K_D = 142.26 μM）、蜂毒素（K_D = 34.98 μM）和泰拉唑普宁（K_D = 73.58 μM）均表现出与S-RBD的可检测结合能力，并抑制了刺突蛋白介导的假病毒进入。分子对接表明，这些相互作用可能通过氢键和π相互作用介导的潜在结合模式实现。这些化合物干扰了S-RBD与hACE2的共定位，并以变异体依赖的方式抑制了假病毒进入。DOTAP氯化物（25 μM）抑制了2019-nCoV和Omicron假病毒的进入，而另外三种化合物在受测变异体中均表现出活性。本研究鉴定出四种具有RBD结合和进入抑制特性的化合物，可作为进入抑制剂进一步开发。