石龙尾不同组织及涝害胁迫下qRT-PCR内参基因的筛选与验证
《Current Issues in Molecular Biology》:Selection and Validation of qRT-PCR Reference Genes in Elsholtzia stauntonii
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时间:2026年09月13日
来源:Current Issues in Molecular Biology 4.1
摘要
选择合适的内参基因并进行验证,是借助实时定量PCR(qRT-PCR)准确进行基因表达分析的前提条件,尤其是在分子研究尚不充分 的植物物种中更为重要。 Elsholtzia stauntonii(石龙尾)是一种具有重要经济价值的观赏、药用和芳香植物。虽然该物种对冷害和干旱具有良好的耐受性,但其对涝害胁迫尤为敏感。迄今为止,关于该物种在不同组织以及涝害胁迫下基因表达的系统的研究尚未广泛开展。本研究选取了包括 GAPDH、ACT、UBQ、UBC、TUA、TUB、EF1-α 和 eIF3K 在内的八个候选内参基因,对来自两个不同组别的13个样品进行了qRT-PCR检测。利用最常用的算法——geNorm、NormFinder、Comparative ΔCt、BestKeeper 和 RefFinder,对这些候选基因的表达稳定性进行了全面评估。结果表明,UBC 和 EF1-α 是不同组织样品中最适合的内参基因;而 ACT、GAPDH 和 UBQ 在涝害胁迫下的叶片中表现出最优的内参基因特性。相比之下,eIF3K 和 TUB 分别被鉴定为不同组织样品和涝害胁迫叶片中稳定性最差的内参基因。为了验证所选内参基因的适用性,分析了苯丙氨酸解氨酶基因1(ElstPAL1)的表达模式。综合考虑内参基因的表现和验证结果,确认 GAPDH 和 ACT 适用于 E. stauntonii 不同组织的qRT-PCR标准化,而 ACT、GAPDH 和 UBQ 对涝害胁迫下的叶片有效。这些研究结果为未来在 E. stauntonii 不同组织及受涝害胁迫的样品中进行基因表达研究奠定了坚实基础,并将有助于推动这一具有重要经济价值物种的后续分子生物学研究。
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