综述：面肩肱型肌营养不良症（FSHD）的纳米孔超长测序：从分子诊断到植入前遗传学检测

《Genes》：Nanopore Ultra-Long Sequencing for FSHD: From Molecular Diagnosis to Preimplantation Genetic Testing

　　面肩肱型肌营养不良症（FSHD）是一种遗传学和表观遗传学高度复杂的常染色体显性肌病，给分子诊断和生殖干预带来了巨大挑战。该疾病由4q35位点D4Z4宏卫星重复阵列内DUX4逆转录基因的病理性去抑制所引起，其触发机制包括：允许性4qA单倍型上重复阵列的病理性缩短（FSHD1，约占95%病例），或表观遗传修饰基因SMCHD1、DNMT3B和LRIF1发生突变导致D4Z4全局低甲基化（FSHD2，约占5%病例）。传统检测方法（Southern印迹、光学基因组图谱、重亚硫酸盐测序）操作不连续且费时费力。纳米孔超长读长测序可单次读取跨越完整的D4Z4阵列，无需重亚硫酸盐转化即可同时解析重复数、单倍型和等位基因特异性CpG甲基化。结合端粒到端粒参考基因组（T2T-CHM13），长程单倍型定相技术使得携带新发致病变异和体细胞嵌合的家系也能进行单基因病植入前遗传学检测（PGT-M），这些群体此前一直被排除在生殖遗传干预之外。本综述系统阐述了FSHD的分子机制、与T2T-CHM13整合的纳米孔诊断工作流程、基于纳米孔的PGT-M临床数据，以及未来展望，包括R11孔蛋白化学、人工智能驱动的生物信息学、CRISPR靶向富集和多组学整合。