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整合BSA-seq和RNA-seq分析以鉴定控制大豆株高的候选基因
《BMC Plant Biology》：Integrated BSA-seq and RNA-seq analysis to identify candidate genes controlling plant height in soybean
【字体： 大 中 小 】 时间：2026年09月14日 来源：BMC Plant Biology 5.6
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摘要大豆（Glycine max L.）是一种全球重要的作物，提供植物油和蛋白质。株高是大豆株型的关键组成部分，显著影响抗倒伏性、种植密度和机械化收获效率。因此，阐明大豆株高的遗传基础对于提高产量至关重要。在本研究中，利用 BSA-seq 和 RNA-seq 分析了两个仅在株
大豆（Glycine max L.）是一种全球重要的作物，提供植物油和蛋白质。株高是大豆株型的关键组成部分，显著影响抗倒伏性、种植密度和机械化收获效率。因此，阐明大豆株高的遗传基础对于提高产量至关重要。在本研究中，利用 BSA-seq 和 RNA-seq 分析了两个仅在株高上存在差异的品种。基于 G′值、ΔSNP-index 和欧几里得距离（ED）的 BSA-seq 分析在第 10 号和第 18 号染色体上鉴定了 1.2 Mb 和 3.3 Mb 的候选区域，包含 108 个基因，其中包括三个具有错义突变的基因：GmWRI1、GmEXPA23 和 GmPPR。此外，RNA-seq 鉴定了 5,019 个差异表达基因，主要富集在植物激素信号传导、MAPK 信号通路和代谢过程中。另外，结合两个数据集与组织特异性表达分析，又鉴定了五个推定基因：GmSEC22、GmFLS2-1、GmFLS2-2、GmPSYR 和 GmPHO1-H9。自然群体的单倍型分析与亲本系的单倍型测序相结合表明，上述八个基因中有四个在不同单倍型间表现出显著的株高差异。这些结果提供了一组优先候选基因，并为阐明大豆株高背后的复杂遗传架构奠定了有价值的基础。
大豆（Glycine max L.）是一种全球重要的作物，提供植物油和蛋白质。株高是大豆株型的关键组成部分，显著影响抗倒伏性、种植密度和机械化收获效率。因此，阐明大豆株高的遗传基础对于提高产量至关重要。在本研究中，利用 BSA-seq 和 RNA-seq 分析了两个仅在株高上存在差异的品种。基于 G′值、ΔSNP-index 和欧几里得距离（ED）的 BSA-seq 分析在第 10 号和第 18 号染色体上鉴定了 1.2 Mb 和 3.3 Mb 的候选区域，包含 108 个基因，其中包括三个具有错义突变的基因：GmWRI1、GmEXPA23 和 GmPPR。此外，RNA-seq 鉴定了 5,019 个差异表达基因，主要富集在植物激素信号传导、MAPK 信号通路和代谢过程中。另外，结合两个数据集与组织特异性表达分析，又鉴定了五个推定基因：GmSEC22、GmFLS2-1、GmFLS2-2、GmPSYR 和 GmPHO1-H9。自然群体的单倍型分析与亲本系的单倍型测序相结合表明，上述八个基因中有四个在不同单倍型间表现出显著的株高差异。这些结果提供了一组优先候选基因，并为阐明大豆株高背后的复杂遗传架构奠定了有价值的基础。
