伊朗北部住院患者尿液样本中大肠杆菌多重耐药序列型131亚克隆C1-M27的高频分布

《BMC Microbiology》：High frequency of multidrug-resistant sequence type 131 subclade C1-M27 among Escherichia coli isolates from urine samples of hospitalized patients in Northern Iran

　　

摘要

背景

尿路感染（UTIs）是一项重大的公共卫生问题，大肠埃希菌（Escherichia coli）是引起大多数病例的主要病原体。在其克隆谱系中，序列型（ST）131 在全球范围内普遍存在，包括演化支 A、B 和 C。C 亚支，尤其是 C1-M27 和 C2，与超广谱 β-内酰胺酶（ESBLs）密切相关。本研究重点关注大肠埃希菌 ST131 分离株的一个子集，旨在确定其演化支和亚支分布以及克隆关系。

方法

共从 2021 年至 2024 年间因尿路感染（UTIs）住院患者的尿液样本中分离出 179 株非重复大肠埃希菌分离株。通过多重 PCR 鉴定 ST131 演化支。通过 PCR 确认了抗菌耐药基因（bla_CTX-M-15、bla_CTX-M-14,bla_TEM、bla_{SHV 和}bla_NDM）的存在、通过 ERIC-PCR 进行的克隆分析以及 O 型。

结果

在总共 179 株大肠埃希菌中，113 株（63.1%）被鉴定为 ST131；主要为 O25b（85%）和 O16（15%）。基于 PCR 的演化支鉴定发现所有三大 ST131 演化支，其中演化支 C（55%）最多，其次是演化支 B（30%）和演化支 A（15%）。在演化支 C 中，亚支 C1 占主导地位，包括 C1-M27 谱系（73%；38/52）。亚支 C2 在演化支特异性耐药谱中表现出最高的多重耐药（MDR）分离株比例（90%）。ERIC-PCR 显示存在显著的遗传异质性，将分离株分为 14 个簇和 7 个单例。

结论

本研究表明，高风险克隆大肠埃希菌 ST131 及其亚支 C1 是我们地区尿路感染的重要贡献者。C1 和 C2 之间不同的耐药模式突显了 ST131 的适应性，强调了持续进行基因组监测和严格实施抗菌药物管理的重要性。