光照性角化病的全基因组荟萃分析识别出12个新位点，并与角化细胞癌及肤色存在重叠

《Communications Biology》：A genome-wide meta-analysis of actinic keratosis identifies 12 novel loci and overlap with keratinocyte carcinoma and pigmentation

　　

摘要

日光性角化病（AK）是一种由慢性紫外线（UV）辐射暴露引起的皮肤癌前病变。先前的研究已鉴定出多个与AK相关的遗传位点，但大规模全基因组关联（GWA）研究有限。在此，我们展示了一项跨五个队列（FinnGen、UK Biobank、Kaiser Permanente成人健康与衰老遗传流行病学研究[GERA]队列、鹿特丹研究和百万退伍军人计划[MVP]）的大型GWAS荟萃分析，共纳入166,553例欧洲裔AK病例和1,179,021例对照。在"All of Us"（AoU）队列中进行了验证。我们鉴定出89个全基因组显著位点，揭示了12个涉及表观遗传调控（TET2）、免疫信号传导（LINC00271、APOLD1、ORMDL3）或其他通路（MIR205HG、ANKRD50）的新位点。我们确认了已知色素沉着和角化细胞癌（KC）基因（IRF4、MC1R、TYR）的作用，并通过条件分析在这些位点上发现了额外的独立信号。使用QSkin研究，通过校正皮肤颜色和KC（包括BCC和cSCC）的全基因组汇总统计数据，进行多元条件分析，结果显示AK的遗传易感性在很大程度上由这两个性状的遗传架构所解释。这一共有的遗传架构得到了计算机模拟功能分析的支持。我们的发现拓宽了对AK发病机制和易感性的认识，有助于改善AK易感性及其进展为KC的风险预测。