使用scMLEAge测定单细胞年龄

《npj Aging》：Determining the age of single cells using scMLEAge

　　

摘要

衰老是一个复杂的生物学过程，其特征是生理功能的逐渐衰退，从而导致疾病易感性和死亡率的增加。许多研究已在单细胞分辨率下探讨了衰老的细胞和分子层面，但个体内细胞衰老的异质性仍知之甚少。为了增强我们在单细胞水平上研究衰老的能力，我们开发了一种统计框架，根据单个细胞的转录组特征预测其年龄。我们的贝叶斯方法通过读数计数估计细胞最可能的年龄。我们将该模型应用于Tabula Muris Senis的数据，并研究了衰老的器官特异性及细胞类型特异性转录组特征。与标准的基于回归的方法相比，我们的框架实现了更高的预测准确性。我们表明，scMLEAge是一个强大的工具，可用于剖析衰老的细胞异质性和年龄相关的功能衰退。