比较转录组学分析揭示了霉素敏感型和耐药型CHO细胞中不同的内质网应激反应

《npj Systems Biology and Applications》：Comparative transcriptomic analysis reveals distinct ER stress responses in tunicamycin sensitive and resistant CHO cells

　　

摘要

衣霉素（TM）是一种N-连接糖基化抑制剂，通过导致错误折叠蛋白的积累来诱导内质网（ER）应激，从而激活未折叠蛋白反应（UPR）以恢复稳态。尽管已在CHO细胞中研究了TM诱导的UPR和ER应激反应，但稳定ER应激耐受性背后的转录适应性机制仍知之甚少。为了区分短暂应激反应与长期适应机制，我们对亲本TM敏感的CHOK1悬浮细胞和TM抗性衍生细胞在TM处理后的转录组进行了比较分析。对亲本CHOK1悬浮细胞进行TM处理会诱导ER应激并激活UPR通路。相比之下，对TM抗性细胞进行TM处理未能诱导UPR或其他应激相关通路，表明存在一种重编程的应激耐受状态。比较转录组分析揭示了与TM抗性和反应性相关的基因类别。值得注意的是，TM抗性细胞表现出应激调节因子的高基础表达水平，包括PERK通路效应分子Gadd34和Chop，这表明存在预适应的转录状态。相反，涉及蛋白加工、细胞周期和代谢的TM响应基因仅在敏感CHO_C细胞暴露时选择性激活。这些发现共同表明，虽然TM会触发幼稚细胞的急性应激反应，但长期适应推动了基础增强ER应激耐受性和持续细胞存活的转录重编程。