摘要
穿山甲深受非法野生动物贸易的影响，但目前对其在救援和康复过程中的病毒组知之甚少，也缺乏病毒组与存活状况之间关联性的研究。本研究通过对获救的马来穿山甲（Manis javanica）的口咽拭子进行宏转录组测序，比较了存活组（S1–S4）与死亡组（D1-D4）个体之间的差异，并对死亡个体的主要器官进行了组织病理学检查。口咽部病毒组以噬菌体以及节肢动物或环境相关病毒信号为主，但存活组与死亡组之间的病毒群落存在显著差异。死亡穿山甲的α多样性高于存活个体，β多样性分析显示两组之间存在显著分离。系统发育分析发现类牛痘病毒、类γ-逆转录病毒和类小RNA病毒序列主要出现在死亡个体中，而类黄病毒和Ghabrivirales相关序列则与饮食或环境暴露最为一致。组织病理学检查显示死亡穿山甲存在多器官病变，包括肺间质损伤、肾小管退化和坏死、肝细胞脂肪变性和坏死、气管黏膜损伤、肠道病变以及局灶性心肌损伤。这些发现表明获救穿山甲的口咽部病毒群落存在异质性，并揭示了存活与死亡个体之间在病毒群落多样性和组成上的差异。鉴于样本量较小且两组之间的采样时间不均衡，这些结果应被视为初步性和探索性的，不应将其解读为病毒信号与死亡率之间存在因果关系的证据。本研究强调了基于病毒组的监测在野生动物救援中的价值，以及仔细区分宿主相关病毒信号与外源性病毒信号的重要性。
