大规模死亡暴发期间养殖大腹海马的性别分层肠道菌群失调
《Current Issues in Molecular Biology》:Sex-Stratified Gut Microbiota Dysbiosis in Cultured Big-Belly Seahorses During a Mass Mortality Outbreak
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时间:2026年09月14日
来源:Current Issues in Molecular Biology 4.1
摘要
大规模死亡暴发威胁着养殖的膨腹海马(Hippocampus abdominalis),但与疾病及宿主性别相关的肠道微生物变化尚不明确。我们分析了来自单一养殖系统的36只海马,分为外观正常雄体(NMHA)、患病雄体(EMHA)、外观正常雌体(NFMHA)和患病雌体(EFMHA)。每只生物重复样本将3个个体的肠道内容物合并,每组获得3个合并重复,共计12个微生物组样本(有效n = 每组3)。对16S rRNA基因的V3–V4区域进行测序,并使用QIIME 2中的DADA2推断ASVs。α多样性显示各组间存在边际性差异,而探索性双因素方差分析表明健康状态及健康状态×性别的交互作用对观测到的ASVs、Shannon指数和Simpson指数有影响。Bray–Curtis PERMANOVA同样检测到健康状态及健康状态×性别交互作用对群落结构的显著影响。变形菌门(Pseudomonadota)主导了所有组别,而弧菌属(Vibrio)在患病雌体中强烈富集,达到86.94 ± 13.03%。LEfSe分析鉴定出弧菌属(Vibrio)/弧菌科(Vibrionaceae)为患病雌体的生物标志物,而弧目菌科(Arcobacteraceae)和Litoreibacter为患病雄体的特征类群。基于PICRUSt2的功能预测表明,患病组中与信号转导、膜运输、生物膜形成、趋化运动和鞭毛组装相关的通路预测丰度更高。总体而言,暴发期间肠道微生物群的失调呈现性别分层模式,其中弧菌属(Vibrio)的显著富集是一种突出的疾病相关微生物特征,在雌体中尤为明显。
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