《The Crop Journal》:ZmARR2 promotes salt tolerance in maize through a redox-related pathway
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土壤盐渍化通过破坏离子与氧化还原(redox)稳态严重限制作物生产力。由Type-B Arabidopsis response regulator(B-ARR,拟南芥响应调节因子B型)介导的细胞分裂素(cytokinin)信号已被认为参与植物胁迫适应,但玉米(
土壤盐渍化通过破坏离子与氧化还原(redox)稳态严重限制作物生产力。由Type-B Arabidopsis response regulator(B-ARR,拟南芥响应调节因子B型)介导的细胞分裂素(cytokinin)信号已被认为参与植物胁迫适应,但玉米(Zea mays)中B-ARR在盐胁迫响应下的下游转录靶标与调控网络尚未被系统阐明。研究人员在玉米基因组中鉴定出9个type-B ARR基因,多数成员表达受盐胁迫响应,其中ZmARR2诱导最强。ZmARR2编码具有转录激活活性的转录因子。功能缺失zmarr2突变体对盐胁迫更敏感,膜损伤更重;过表达ZmARR2植株Na+含量改变且盐胁迫下存活增强。DNA亲和纯化测序(DAP-seq)与RNA测序(RNA-seq)显示其靶基因参与氧化还原酶(oxidoreductase)活性、金属离子结合与蛋白质折叠。整合分析与原位荧光素酶报告实验表明ZmARR2正调控ZmRBOH4,该基因编码呼吸爆发氧化酶同源蛋白(respiratory burst oxidase homolog,RBOH),负责活性氧(reactive oxygen species,ROS)产生,可能通过调控ROS介导信号参与耐盐。研究将ZmARR2确定为ZmRBOH4依赖ROS信号调控因子,为玉米中细胞分裂素介导盐耐受提供分子证据。
研究背景方面,土壤盐渍化因气候变化与过度灌溉持续扩张,高NaCl抑制光合与蛋白合成,引发活性氧(reactive oxygen species,ROS)过量、氧化胁迫、离子毒性和营养失衡。细胞分裂素(cytokinin)信号经组氨酸激酶、磷酸传递蛋白到ARR的多步磷酸中继传导,Type-B ARR(B-ARR)为转录激活因子,拟南芥与水稻中B-ARR或A-ARR功能存在物种差异;玉米中ZmRR1等已有研究,但玉米B-ARR尤其是盐胁迫功能未系统研究。该研究由西北农林科技大学农学院团队开展,论文发表于《The Crop Journal》。研究人员鉴定玉米9个B-ARR,发现ZmARR2受盐和6-BA诱导最强,通过EMS突变体、CRISPR/Cas9敲除(knockout,KO)与过表达(overexpression,OE)材料证明ZmARR2正调控盐耐受;整合RNA-seq与DAP-seq鉴定178个高置信靶基因,并验证ZmARR2直接正调控ZmRBOH4,意义在于揭示玉米细胞分裂素信号通过redox相关通路耐盐的物种特异性机制,为育种提供候选基因。
主要关键技术方法:样本来自玉米自交系B73与KN5585及衍生的EMS诱导突变体zmarr2-1、zmarr2-2、CRISPR/Cas9 KO系与Ubiquitin启动子驱动OE系;采用RT-qPCR分析组织与胁迫表达,酵母转录激活实验与核定位实验表征ZmARR2,RNA-seq比较WT/KO/OE在盐胁迫下根叶转录重编程,DAP-seq以KN5585基因组DNA富集ZmARR2结合位点,双荧光素酶报告实验验证靶基因转录调控。
3.1 Identification, promoter analysis, and expression profiling of maize B-ARR genes
研究人员用隐马尔可夫模型以REC_typeB_ARR-like与Myb-SHAQKYF结构域鉴定出9个非冗余B-ARR(ZmARR1–9),染色体定位显示ZmARR2与拟南芥AtARR10、AtARR12及水稻OsRR22聚为一支;启动子含ABRE、MYB、MBS、LTR等胁迫元件;公共转录组与RT-qPCR表明ZmARR2在根、茎尖分生组织高表达,盐与6-BA处理下叶片12 h、根3 h显著诱导,是候选耐盐因子。
3.2 ZmARR2 functions as a nuclear transcriptional activator that enhances salinity-stress tolerance
ZmARR2-GFP定位于细胞核,MYB-like结构域单独具转录激活能力。EMS与CRISPR KO幼苗盐胁迫下叶黄化、存活率降低、MDA升高、SOD/POD/CAT活性下降;OE系存活率显著提高。离子测定显示OE系地上部Na+升高、根部Na+与K+降低,提示ZmARR2通过根到冠Na+再分配缓解根毒害。
3.3 Identification of target genes of ZmARR2
RNA-seq在根、叶分别定义六大表达簇,根富集跨膜运输、过氧化氢分解,叶富集谷胱甘肽代谢与胁迫响应。DAP-seq获5429个结合峰对应4461个基因,与叶DEGs交集得178个高置信靶:正调基因富蛋白质折叠、叶绿体、氧化还原酶(oxidoreductase)活性,负调基因富转录因子活性与金属离子结合。ZmRBOH4启动子有结合峰,RNA、RT-qPCR与双荧光素酶证实ZmARR2正调控ZmRBOH4,指向redox相关通路。
讨论部分总结:ZmARR2是核内转录激活因子,盐与细胞分裂素信号汇聚诱导其表达,形成激素—环境整合回路;与拟南芥AtARR10/12、水稻OsRR22负调耐盐不同,ZmARR2正调玉米耐盐,体现禾本科B-ARR功能分化。其机制不是单纯减少Na+吸收,而是促进Na+从根向冠转运并在冠部液泡隔离,同时激活氧化还原酶、蛋白质折叠、叶绿体保护,抑制金属离子结合与次级转录因子。研究提出ZmARR2—ZmRBOH4—ROS工作模型,并指出苗期可控条件结果需田间多环境验证。
结论部分翻译:综上,研究人员证明ZmARR2直接靶向编码ROS产生呼吸爆发氧化酶同源蛋白的ZmRBOH4,建立细胞分裂素(cytokinin)信号与氧化还原(redox)调控间分子联系以赋予玉米盐胁迫耐受性。不同于水稻与拟南芥中功能为负向的同源物,ZmARR2通过影响组织特异性Na+再分布与氧化还原酶相关通路转录重编程,作为盐胁迫耐受正向调控因子起作用。这些发现揭示了禾本科中B-ARR功能的谱系特异性分化,并为玉米盐胁迫耐受遗传改良提供候选靶点。