商品杂交猪宿主基因组与肠道微生物群对肉质性状的协同调控研究

《BMC Genomics》：Comprehensive analysis of host genetics and gut microbiota co-regulatory network provides new insights into improving pork quality in pigs

　　

摘要

背景

猪肉品质由宿主遗传和肠道微生物群共同调控，但两者的相互作用机制仍不明确。我们对257头商品杜洛克×(长白×大约克)杂交猪进行了整合全基因组和全微生物组关联研究，评估遗传和微生物对内肌脂肪、肉色、大理石纹和水分含量的影响。

结果

肉质性状表现出中等遗传力（0.13–0.60），但微生物解释力较低（0.00-0.07）。研究鉴定出30个影响微生物丰度的宿主SNPs，包括位于CDH13、APOB、LDAH和ACSL1基因附近的位点，这些基因与脂质代谢相关。七种细菌类群与肉质性状存在关联，肉质改善与Anaerobiospirillum、Parvimonas、Anaerovibrio和Oscillospira丰度降低以及Anaeroplasma、WAL_1855D和Prevotella富集相关。

结论

猪基因型、微生物菌群与肉质表型之间的三方互作模式提示宿主-微生物组之间存在协调但数量效应相对温和的关联。所鉴定的基因组位点和细菌类群可作为宿主-微生物组网络的候选组分，可能参与脂质沉积和肌肉特性调控。这些发现为进一步的机制研究和验证研究提供了基础，并对未来生猪精准育种和微生物组指导型管理策略的发展具有潜在意义。