印度野生与圈养豹肠道微生物组差异研究

《BMC Microbiology》：Captivity-driven gut dysbiosis in leopards (Panthera pardus): effects of diet and rearing practices

　　

摘要

印度是生物多样性热点地区，孕育着丰富的生命形式，其中包括大型猫科动物。在大型猫科动物中，豹广泛分布于该国的各类地理地形。由于与人类聚居地距离密切以及持续存在的冲突状况，许多豹因冲突、受伤或成为孤儿而被救助，随后在长期圈养或人工饲养条件下被维护。在野外，豹以多样化的猎物为食；然而在圈养环境下，饮食和喂养模式保持单一。这种饮食简化与圈养管理对肠道微生物组组成的影响尚不明确。在本研究中，对野生、圈养和人工饲养豹的肠道微生物组进行了评估和比较，以估算微生物多样性，并进行了生物信息学分析以评估微生物多样性、分类组成和差异丰度。共收集了22份新鲜粪便样本，包括来自野生（n?=?9）、捕获后圈养（n?=?8）和人工饲养圈养豹（n?=?5）的样本。两份野生样本（W5和W8）因基因分型失败而被排除在多样性分析之外，最终有20份样本（野生n?=?7，圈养n?=?8，人工饲养n?=?5）用于后续生态分析。β多样性和多变量分析显示野生组和圈养组之间存在明显分离，凸显了圈养管理对肠道微生物结构的强烈影响。分类分析表明，拟杆菌门和厚壁菌门在野生豹中占主导地位，而圈养和人工饲养的豹则显示厚壁菌门和变形菌门丰度增加，包括若干与菌群失调相关的分类群。差异丰度分析确定了特定的细菌物种作为圈养相关微生物变化的潜在指标。这些发现表明，圈养，尤其是长期限制和以单一饮食进行人工饲养，显著改变了豹的肠道微生物组。本研究强调了饮食多样化及基于微生物组信息的管理策略对于改善圈养豹的健康与福利以及提升保护成效的重要性。