山羊皮下脓肿的病原菌特征与肠道微生物群变化研究

《BMC Veterinary Research》：Pathogen detection and gut microbiota analysis in subcutaneous abscesses in goats

　　

摘要

山羊的皮下脓肿会导致胴体被拒收、牛奶和羊毛产量下降、生长受阻以及死亡率增加，从而给山羊养殖系统带来巨大的经济损失。本研究调查了与山羊皮下脓肿相关的主要病原体，并分析了患病动物肠道微生物群的变化。对来自同一农场的554只萨能山羊进行的横断面调查显示，临床脓肿的整体发生率为13.0%（72/554）。雄性山羊的发病率高达39.6%（21/53），明显高于雌性山羊（10.2%；51/501）。皮下脓肿主要出现在脸颊、颈部、肩部和腹部。通过分离和培养脓肿样本发现，Corynebacterium pseudotuberculosis是主要病原体（68.1%），其次是Trueperella pyogenes（18.1%）、Staphylococcus aureus（16.7%）和Escherichia coli（9.7%）。单病原体感染占病例的93.1%，而涉及两种或三种病原体的混合感染分别占5.6%和1.4%。此外，粪便微生物群测序显示健康山羊和患病山羊的肠道微生物群存在明显差异。患病山羊的微生物多样性较低，菌群结构发生变化，有益的Lactobacillus菌株减少，而机会性病原体如Escherichia-Shigella增加。共现网络分析显示，患病山羊的优势细菌属发生了显著变化，物种间的关联从主要为正向相关转变为负相关。总之，这些结果为该疾病的精准预防和控制提供了新的见解，并为基于微生物组的干预策略提供了可能。