《Poultry Science》：Salmonella in broiler breeder flocks in Israel during 2008-2018: Prevalence, Risk factors and Repeated detections
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非伤寒沙门氏菌（non-typhoidal Salmonella）感染对肉种鸡群（broiler breeder flocks）构成重大的经济挑战，并增加公共卫生风险。本研究旨在确定以色列商业化肉种鸡群感染的流行率（prevalence）和风险因素（risk
非伤寒沙门氏菌（non-typhoidal Salmonella）感染对肉种鸡群（broiler breeder flocks）构成重大的经济挑战，并增加公共卫生风险。本研究旨在确定以色列商业化肉种鸡群感染的流行率（prevalence）和风险因素（risk factors），以及重复检出（repeated detections）的风险。
数据包括来自142个农场的4,100个鸡群的普查数据，共64,217项检测结果，来源于2008–2018年全国监测计划（national surveillance program）记录。流行率分别在检测、鸡群和农场层面计算。采用单因素和多因素混合效应逻辑回归模型（univariable and multivariable mixed-effect logistic regression models）评估检测层面的风险因素，并考虑鸡群和农场内的聚集性。重复检出在鸡群和农场层面分别使用描述性统计和逻辑回归模型进行分析。此外，还比较了感染肉种鸡群和人类的优势血清型（serotypes）的流行率和发病率。
平均每年有6.7%的检测为沙门氏菌阳性，29.6%的鸡群和59.6%的农场每年至少检测到一次阳性。总共鉴定出91种血清型，其中五种优势血清型（Infantis、Hadar、Kentucky、Muenchen和Virchow）占分离株的67%。沙门氏菌检出的风险在秋季、较年轻的鸡群（≤45周龄）、由以色列兽医服务机构（Israeli Veterinary Services）采样、中部地区（相对于南部）以及Ross品种中较高。重复检出（至少两次阳性检出）出现在约70%的阳性鸡群中，初次检出后后续检测的平均阳性率为13%；初次检出时年龄较大（>45周龄）和Ross品种（相对于其他品种）增加了重复检出的几率。肉种鸡群与人类之间血清型的比较显示，优势血清型存在显著重叠，但与肠炎沙门氏菌（Enteritidis）和鼠伤寒沙门氏菌（Typhimurium）血清型没有重叠。
总体而言，研究人员的发现强调了肉种鸡群沙门氏菌病（salmonellosis）复杂的流行病学特征。尽管持续采取控制措施，但这些鸡群中沙门氏菌的高流行率和持续性凸显了在缓解这一重要病原体和保护食物链方面仍存在的知识空白。
非伤寒沙门氏菌（non-typhoidal Salmonella）感染是全球最重要的人兽共患病之一，家禽及其产品是其主要传染源。肉种鸡群（broiler breeder flocks）作为肉鸡生产的源头，若感染沙门氏菌，可经垂直和水平传播污染整个产业链，因此各国普遍将种鸡群监测作为食品安全策略的核心环节。以色列自1994年起实施国家沙门氏菌监测控制计划，虽然肠炎沙门氏菌（S. Enteritidis）和鼠伤寒沙门氏菌（S. Typhimurium）在种鸡群中的流行率已被控制在较低水平，但总沙门氏菌感染率仍然较高，部分鸡群和农场反复感染。为此，研究人员开展了一项基于全国监测数据的普查性研究，旨在确定2008–2018年间以色列商业肉种鸡群沙门氏菌感染的流行率、感染风险因素以及重复检出的风险，并比较鸡群与人类中优势血清型的分布，以评估公共卫生意义。
该研究纳入以色列全国142个农场的4,100个肉种鸡群，共64,217条检测记录，来源于强制性国家监测计划。研究人员在检测、鸡群和农场三个层面计算了沙门氏菌流行率；采用单因素和多因素混合效应逻辑回归模型识别检测层面的风险因素，并利用Kaplan-Meier生存分析估计鸡群首次检出的时间；在鸡群和农场层面分别分析了重复检出的比例并构建逻辑回归模型；同时将鸡群分离株的血清型与同期人类临床病例的血清型数据进行比较。
**2008–2018年以色列肉种鸡群沙门氏菌流行率**：平均每年有6.7%的检测结果为沙门氏菌阳性，2011年最高（13.4%），2018年最低（3.1%）。每年平均有29.6%的鸡群和59.6%的农场至少检出一次阳性。共鉴定出91种血清型，其中五种优势血清型（Infantis、Hadar、Kentucky、Muenchen和Virchow）占分离株的67%。S. Infantis比例从2011年的46.3%降至2018年的6.7%，而S. Muenchen从1.9%升至31.7%，成为2018年最主要血清型。
**沙门氏菌及血清群的地理区域分布**：不同以色列禽蛋委员会（Egg and Poultry Board, EPB）地理区域的检测阳性率（5.0%–7.5%）、阳性鸡群比例（33.2%–42.1%）和阳性农场比例（81.8%–100%）存在差异。S. Infantis在所有区域均为最常见的血清型。南部地区血清群E的比例显著高于其他区域，主要由两个农场反复检出Anatum和Lexington血清型所致。
**鸡群感染的风险因素**：单因素分析显示季节、鸡群日龄、区域、采样者和品种均与检出相关；多因素混合效应逻辑回归模型证实，秋季（相对于冬、春、夏季）、鸡群日龄≤45周、由以色列兽医服务机构（IVS）采样（相对于农场主）、中部地区（相对于南部）以及Ross品种（相对于Cobb和其他品种）均显著增加沙门氏菌检出的风险。
**鸡群内重复检出**：在首次检出后至少有9次检测记录的1,270个阳性鸡群中，69.4%的鸡群在首次检出后再次检出沙门氏菌，平均后续检测阳性率为13.1%。单因素和多因素逻辑回归显示，首次检出时鸡群日龄>45周（OR=1.
