细胞外囊泡分离与成像方法的比较评估:超速离心、动态光散射与lacey碳网格透射电镜的应用

《Journal of Extracellular Biology》:Comparative Assessment of Methods for Isolation and Imaging of Extracellular Vesicles

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月15日 来源:Journal of Extracellular Biology 4.8

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  来自特定细胞来源的细胞外囊泡(extracellular vesicles, EVs)正成为具有治疗潜力的载体。单个细胞群体的EV和非EV分泌组也可用作细胞身份或状态的衡量标准。因此,EV属性和组成可能有助于定义细胞群体在药物测试、生物学模型和细胞治疗产品中的

  
来自特定细胞来源的细胞外囊泡(extracellular vesicles, EVs)正成为具有治疗潜力的载体。单个细胞群体的EV和非EV分泌组也可用作细胞身份或状态的衡量标准。因此,EV属性和组成可能有助于定义细胞群体在药物测试、生物学模型和细胞治疗产品中的“适用性”质量。由此,需要具有成本效益的EV分离和严格表征的方法。研究人员旨在评估当前方法,并建立有效且可能改进的技术以满足这些需求。

首先,研究人员评估了超速离心、超滤和沉淀法作为从培养扩增的人间充质基质细胞(human mesenchymal stromal cell, hMSC)群体中分离EV的手段。其次,比较了传统的formvar和改进的lacey碳透射电子显微镜(transmission electron microscopy, TEM)网格制备。第三,评估了电子能量损失谱(electron energy loss spectroscopy, EELS)用于EV元素含量表征。第四,评估了动态光散射(dynamic light scattering, DLS)作为表征hMSC群体间EV尺寸分布差异的工具。最后,使用来自5位人类供体的28个培养扩增hMSC群体分离的EV群体,将DLS测量与直接TEM尺寸测量进行了比较。

超速离心在每次视觉TEM分析中最有效地提供了更高的EV纯度和产量。Lacey碳TEM网格为EV形态的视觉表征提供了最有效的成像,并实现了样品的持久存档以进行不连续评估。EELS鉴定了脂质双分子层中的磷,但无法有效鉴定EV的硫(蛋白质)和氮(蛋白质、RNA、DNA)含量。DLS在表征EV群体尺寸分布方面总体一致,但基于直接比较的TEM观察发现了差异和局限性。

本研究证明,超速离心、DLS尺寸表征以及用lacey碳TEM网格制备进行确认,可提供高质量的样品,并有效评估EV尺寸分布和形态。
细胞外囊泡(extracellular vesicles, EVs)是细胞释放的纳米级膜性小泡,在细胞间通讯中发挥重要作用,并日益被视为潜在的药物递送载体和细胞状态标志物。单个细胞群体的EV和非EV分泌组可反映细胞身份或状态,因此EV的属性和组成可能用于评估细胞群体在药物测试、生物学模型及细胞治疗产品中的“适用性”。然而,目前EV分离和表征方法多样,包括基于密度、尺寸、沉淀和亲和的方法,文献中关于这些方法的产率和纯度比较多依赖相对评估,缺乏绝对数值标准。传统透射电子显微镜(TEM)制样通常涉及固定和负染色,可能破坏EV形态并引入碎片;动态光散射(DLS)作为间接测量技术,难以区分目标EV与碎片或聚集体。因此,开展本研究旨在系统比较不同EV分离和成像方法,建立更有效、可靠且成本可控的技术方案。

研究人员从培养扩增的人间充质基质细胞(hMSC)群体中收集条件培养基,平行采用超速离心、超滤和沉淀法分离EV,并通过TEM评估三种方法的纯度和产量。结果显示,超速离心在视觉分析中提供最高的EV形态保存和清洁度,脂质双分子层清晰可见。随后,研究人员比较了传统formvar碳网格(固定、负染)与自制的lacey碳网格(无固定、无染色)制备方法,发现lacey碳网格无需固定和染色即可清晰显示EV的脂质双分子层,且可见EV数量更多、尺寸多样性更大,样品在真空室温下保存至少一年仍无退化。在元素表征方面,利用电子能量损失谱(EELS)检测EV中的磷(脂质双分子层)成功,但未能有效检测硫(蛋白质)和氮(蛋白质、RNA、DNA),主要受磷峰与氯峰、碳峰重叠以及探测器光谱分辨率限制。在尺寸表征方面,DLS用于测量31个EV群体(来自5位供体的16个多克隆和15个单克隆hMSC群体),其中28个样本同时进行TEM测量并直接比较。结果发现,两种方法测得的总体平均直径无显著差异(DLS为161.1 nm,TEM为172.9 nm,p=0.341),但28个样本中有9个存在显著差异;DLS测量结果提示单克隆来源EV显著小于多克隆来源(p=0.049),而TEM数据不支持该结论(p=0.941)。通过直方图比较,两种方法在40–200 nm范围内识别的主要尺寸区间常相似,但DLS有时会探测到>200 nm的大颗粒,可能来自碎片或聚集体,而TEM可经直接观察排除此类干扰。

本研究采用的主要关键技术方法包括:①超速离心(差速离心至100,000×g)、超滤(100 kDa膜截留)和PEG/DEX沉淀法用于EV分离;②传统formvar网格(固定、负染)与自制lacey碳网格(无固定、无染色)用于TEM制样比较;③EELS在Titan3 G2 60–300 S/TEM上以300 kV采集光谱,用于元素组成分析;④DLS(Wyatt Technologies Mobius)每样本采集15次、每次30秒读数;⑤28个EV样本的TEM图像通过ImageJ测量每个EV的费雷特直径,每样本盲测100个EV,并与DLS结果进行Welch t检验。样本队列来源为5位人类供体的培养扩增hMSC群体,其中16个为多克隆(CEM)、15个为单克隆(PBS),分别取自第3代和第5代培养。

研究结果分述如下:

**3.1 EV分离方法**:通过TEM在lacey碳网格上视觉比较,超速离心产生的样品最干净、产量高,且EV脂质双分子层形态保存良好;超滤样品可见EV但存在残留培养基形成的粘性膜状物;沉淀样品除粘性膜外还有额外碎片。因此,超速离心被选为后续研究的标准分离方法。

**3.2 传统formvar与简化lacey碳TEM网格制备比较**:lacey碳网格无需固定或负染,所得TEM图像中EV边界清晰、脂质双分子层明显,且单位视野内EV数量更多、尺寸分布更广;而formvar网格制备的样品中EV较小、双分子层模糊,周围碎片较多。此外,lacey碳制备的样品在储存1个月和1年后重复成像未见退化,表明其可用于样品长期存档和不连续评估。

**3.3 EELS评估EV元素组成**:EELS在132 eV附近检测到磷峰,对应脂质双分子层;但未能在165 eV处检测到硫(蛋白质)峰,也未能检测到402 eV处氮(蛋白质、RNA、DNA)峰,原因可能是磷峰(160 eV)、残留PBS产生的宽氯峰(200 eV)以及lacey碳网格产生的碳峰(284 eV)重叠,且受探测器光谱分辨率限制。

**3.4 TEM与DLS测量EV尺寸和变异的比较**:对31个EV样本进行DLS测量,其中28个成功获得TEM数据。整体平均直径在两种方法间无统计显著差异(p=0.341),但个体样本比较中,19个无显著差异、9个显著差异(其中7个TEM均值较大,2个较小)。DLS提示克隆EV小于多克隆EV(p=0.049),但TEM显示两者无差异(p=0.941)。直方图分析显示,在50 nm分箱下,EV主尺寸范围常见于40–200 nm区间,但DLS有时出现>200 nm的亚群,可能代表聚集体或碎片,而TEM可直接排除这些干扰。

在讨论部分,作者总结了超速离心的优势与文献一致,同时指出了其设备昂贵、耗时约3小时、可能共分离小型外泌体等局限性。Lacey碳网格被强调为首创的EV TEM制备方法,具有省时(<5分钟)、高清晰度、可存档等优点,但样品对电子束较敏感,需在60–80 kV下观察。EELS不是本研究的核心手段,其灵敏度受样品制备和光谱重叠限制,但磷检测仍可作为EV完整性验证的指标。DLS快速便捷,适合大规模筛查,但因其间接测量原理无法排除碎片和聚集体,应与TEM结合使用。研究结论部分翻译如下:

**结论**:EV可能作为细胞群体生物学状态或功能属性的读出手段,也可能发展为独立的治疗载体。本文为hMSC来源EV群体的分离和表征提供了有效方法,这些发现很可能适用于许多其他细胞来源的EV。研究证明,超速离心是EV分离中产率和纯度较高的最有效方法之一,并应通过EV生物标志物分析进一步确认。研究人员首次报道了无需固定、染色或冷冻电镜的lacey碳TEM网格制备方法,用于EV的成像和评估,为EV形态评估提供高效手段,并支持样品的持久存档,应当被视为未来TEM制备的首选方法。TEM图像是评估EV尺寸和形态最直接、最可靠的方法,未来需要自动化图像分割和分析技术以减少人工操作。DLS是一种成本较低、资源需求少的测量手段,可用于估算EV尺寸,但作为间接测量方法易受碎片和聚集体干扰,必须用TEM进行验证。EELS方法并非本分析的关键,其应用受分辨率限制及氯和碳污染峰影响,但通过改进样品制备可能提高分辨率。
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