北部南海和北部湾Evynnis cardinalis的线粒体遗传多样性、种群结构与历史动态

《Scientific Reports》：Mitochondrial genetic diversity, population structure and late Pleistocene demographic expansion of Evynnis cardinalis in the northern South China Sea

　　

摘要

了解历史过程与当代海洋学如何塑造种群连通性和种群动态，对于有效管理近海鱼类至关重要。本研究利用线粒体细胞色素c氧化酶亚基I（COI）序列，调查了Evynnis cardinalis（Lacepède 1802）在北部南海和北部湾25个采样点的遗传多样性、种群结构和种群历史。共分析315个个体的数据，结果表明等位基因多样性较高但核苷酸多样性较低，并呈现出以少数广布单倍型和大量低频特有单倍型为主导的星状单倍型网络。这些模式是有效种群规模下降后近期种群扩张的典型特征。两两Φ_ST值、AMOVA（分子方差分析）和主坐标分析均表明该区域遗传分化较弱且单倍型共享广泛，提示线粒体遗传分化有限且线粒体单倍型在整个研究区域内广泛共享；然而，仅凭单一的线粒体标记难以对当代基因流做出稳健的推断。尽管如此，在雷州半岛东西两侧检测到了微弱但显著的遗传组分差异，表明区域地形和海洋学条件可能有助于形成微弱的线粒体遗传分化，而未构成强屏障。中性检验、错配分布分析和贝叶斯天空线图重建一致支持晚更新世种群扩张事件，估算的扩张时间大致在1.8万至9万年前之间。我们推测，冰期-间冰期海平面波动反复改变了大陆架生境的分布范围和连通性，在塑造Evynnis cardinalis的种群历史中发挥了核心作用，而当今季风驱动的环流和琼州海峡的持续水体输运则有助于维持当代的种群连通性。综上所述，本研究结果强调了历史海平面变化与现代海洋学过程共同塑造边缘海鱼类遗传格局的影响，并为北部南海Evynnis cardinalis的保育与管理提供了遗传学基线。