摘要
微小RNA（miRNA）在癌症中常发生失调，然而其在恶性转化过程中组织特异性的重塑机制仍未得到充分阐明。在本研究中，我们以Tau指数作为主要指标、Gini指数进行独立验证，系统量化了正常组织（GTEx）和癌症组织（TCGA）中miRNA的组织特异性。分析结果揭示，健康组织中miRNA的组织特异性与其在恶性转化过程中特异性变化之间存在负相关关系，表明在正常组织中组织特异性越高的miRNA，在癌症中特异性丧失越显著。为了稳健地定义失调，我们结合了两项独立分析：一项基于TCGA队列中17种匹配正常组织的逐项目差异表达的二项检验，以及一项TCGA与GTEx之间的全组织平均表达比较。特异性变化（ΔTau）有效区分了上调与下调的miRNA，与二项检验信号呈中等一致性，且与基于表达的差异比较呈强相关。最后，我们鉴定出六个在转化过程中丧失组织特异性但持续保持上调的miRNA（miR-519a-5p、miR-512-3p、miR-522-3p、miR-105-5p、miR-935、miR-1269a）。对其实验验证靶标及预测靶标的功能分析显示，显著富集于汇聚到核心致癌通路。总之，将特异性动态变化与失调证据相结合，能够确定具有协同且与癌症相关的调控功能的候选miRNA，并突出了那些具有良好组织特异性特征的miRNA，它们可能值得作为潜在治疗候选物进行进一步研究。
