空间转录组学证据支持大脑皮层的镶嵌假说和纯细胞类型

《Cell Reports》：Evidence from spatial transcriptomics for the mosaic hypothesis and pure cell types in the cortex

　　

正文

（Cell Reports 44，116363；2025年10月28日）

本文最初发表时，在小鼠皮层稀疏GABA能点模式的分区DCLF检验中使用了一种不适当的默认并列处理规则，导致某些GABA能类型的p值不正确。

在初始分析中，作者对所有GABA能类型均使用了R包spatstat.explore::dclf.test中的默认随机并列破解规则。发表后，作者确定对于稀疏类型应使用不同的并列破解规则tie.rule = "mean"，通过将并列统计量赋予其平均排名来避免并列破解带来的随机性。在重新分析期间，作者还将DCLF检验中使用的最大半径从120 μm扩大到240 μm，以修正GABA能分析。

初始测试造成的错误影响了表1、S4和S8以及补充数据描述中的某些p值和/或R值。表1中受影响的类型包括0754 Pvalb Gaba_8、0740 Pvalb Gaba_3、0741 Pvalb Gaba_3、0624 Vip Gaba_1、0641 Vip Gaba_5、0645 Vip Gaba_6、0747 Pvalb Gaba_4、0742 Pvalb Gaba_3、0811 Sst Gaba_13和0709 Lamp5 Gaba_1。表S8中受影响的类型包括0740 Pvalb Gaba_3、0742 Pvalb Gaba_3、0776 Sst Gaba_4、0819 Sst Gaba_16和0798 Sst Gaba_9。

这些错误继而导致图2和图6B中报告的p值不正确。

这些表格、图表和数据描述已更新。作者对由此错误可能引起的任何混淆表示歉意，并感谢Ian Convy发现了该问题。

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图2 十种GABA能类型在多切片上统计检验程序的示意图（修正后）

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图2 十种GABA能类型在多切片上统计检验程序的示意图（原始版本）

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图6 混合类型中p值升高，表明同类排斥消失（修正后）

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图6 混合类型中p值升高，表明同类排斥消失（原始版本）