BRAF 靶向治疗中 VAF 与共突变复杂性对疗效及预后的预测价值

《npj Precision Oncology》：A hierarchical genomic framework associated with response to BRAF-directed therapy across solid tumors

　　

摘要

BRAF靶向治疗在不同实体肿瘤中的疗效存在差异，而除突变状态之外的分子预测因素仍不明确。我们回顾性分析了67名患有BRAF改变的实体肿瘤患者（这些肿瘤涉及九种不同的组织类型），这些患者均接受了BRAF靶向治疗。我们使用病毒抗原频率（VAF）来评估克隆性（≥5% vs <5%）和共突变复杂性（简单[0–1]、中等[2–3]、复杂[4+]），并将其作为预测生物标志物。在60名可评估的患者中，客观缓解率（ORR）为55%（95%置信区间：42–67%）。VAF ≥5%的患者其无进展生存期（PFS）显著长于VAF <5%的患者（中位PFS分别为13.2个月和7.5个月；风险比HR为0.36，95%置信区间：0.14–0.90；p = 0.021；克隆性与亚克隆性相比），且ORR也更高（55% vs 33%）。共突变复杂性增加与PFS缩短相关（每增加一层共突变复杂性，HR增加1.84；p = 0.009）。VAF ≥5%且具有简单共突变特征的患者是预后最好的亚组（ORR为70%）。通过对AACR GENIE v19.0数据库中的17,033个BRAF突变样本进行外部验证，确认了不同机构间VAF分布的一致性。我们提出了一个整合克隆性和共突变复杂性的层次化基因组框架，该框架值得进一步的前瞻性验证。