染色质修饰因子是转录因子在增强子上从头结合的必需条件

《Nature Communications》：Chromatin modifiers KMT2D, cBAF, and p300 cooperatively facilitate de novo binding of transcription factors on enhancers

　　

摘要

转录因子（TFs）结合增强子并招募H3K4me1甲基转移酶KMT2D、染色质重塑因子cBAF以及H3K27乙酰转移酶p300来激活转录。然而，染色质修饰因子在调控转录因子于增强子上的从头结合中的作用仍不明确。利用一种稳健的细胞核转位系统，我们证明肌肉谱系决定转录因子MyoD在一小时内广泛结合染色质，其中一半的诱导性MyoD结合位点被KMT2D、cBAF和p300共同占据。在这些MyoD⁺增强子中的大多数位点上，急性耗竭KMT2D或短期抑制cBAF或p300的酶活性，会显著降低MyoD以及KMT2D、cBAF和p300的从头结合。在经历上述扰动后MyoD结合依然完好的增强子上，我们观察到染色质修饰因子之间的协同招募作用。信号依赖性转录因子糖皮质激素受体与KMT2D、cBAF和p300之间也观察到类似的相互依赖关系。综上，我们的发现表明染色质修饰因子不仅是下游效应因子，也是转录因子在增强子上从头结合所必需的，从而完善了一个增强子建立模型：该过程由功能协作而非严格的层级关系所支配。