基于运动校正单粒子追踪推断生物分子凝聚体势能差异的方法

《Biophysical Journal》：A Single-Particle Tracking Framework for Quantifying Intracellular Partition Free Energies

　　生物分子凝聚体是无膜细胞器，能在特定空间位置局部富集特定分子。一个核心挑战是确定单个凝聚体的物理参数，因为它们的尺寸通常低于常规显微镜的衍射极限。单粒子追踪克服了这一限制，但从轨迹集合中提取物理可观测量的稳健方法仍然稀缺。在此，我们提出了一个框架，用于推断凝聚体内部分子与周围环境中分子之间的势能差异。我们引入了一种校正方法，考虑采集过程中凝聚体的运动，即使在稀疏数据的情况下也能实现可靠的密度估计。在模拟数据上测试后，我们将该方法应用于5个参与DNA修复的蛋白质的实验数据集，并根据焦点的液态性质将它们进行分类。Malthe S. Nordentoft | Emilie Jessen | Enora Corsin | Judith Mine-Hattab | Mogens H. Jensen | Mathias S. Heltberg