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红树林栖息双壳类Enigmonia aenigmatica的染色体水平参考基因组组装与注释

《Scientific Data》:Chromosome-level genome assembly of the mangrove-dwelling bivalve Enigmonia aenigmatica (Pectinoida: Anomiidae)

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月22日 来源:Scientific Data 7.2

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   摘要Enigmonia aenigmatica 是一种独特的红树林栖息双壳类物种,具有显著的生态和形态适应性,然而其基因组背景一直未被探索。在本研究中,我们结合 PacBio HiFi 长读长、全基因组测序(WGS)短读长、Hi-C 数据、Oxford Nanopore 长读

  

摘要

Enigmonia aenigmatica 是一种独特的红树林栖息双壳类物种,具有显著的生态和形态适应性,然而其基因组背景一直未被探索。在本研究中,我们结合 PacBio HiFi 长读长、全基因组测序(WGS)短读长、Hi-C 数据、Oxford Nanopore 长读长转录组测序以及 Illumina 短读长转录组测序,组装并注释了 E. aenigmatica 的高质量参考基因组。我们获得了染色体水平的基因组组装,基因组总大小为 465.97 Mb,包含 8 条染色体。该组装表现出卓越的连续性,支架 N50 为 58.83 Mb。全面的基因注释鉴定了 17,728 个蛋白编码基因。该 E. aenigmatica 的染色体水平基因组为未来研究红树林相关双壳类、软体动物进化以及潮间带环境中的生态适应提供了宝贵的基因组资源。

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