《Human Genetics and Genomics Advances》:Elucidating shared genetic signals between type 2 diabetes and three neurodegenerative dementia phenotypes
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2型糖尿病(type 2 diabetes, T2D)与痴呆经常共存,但这种共病背后的生物学机制仍不完全清楚。本研究利用大规模临床诊断个体的全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS),系统研究了T2D与三种形式的
2型糖尿病(type 2 diabetes, T2D)与痴呆经常共存,但这种共病背后的生物学机制仍不完全清楚。本研究利用大规模临床诊断个体的全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS),系统研究了T2D与三种形式的神经退行性痴呆——阿尔茨海默病(Alzheimer disease, AD)、路易体痴呆(Lewy body dementia, LBD)和散发性额颞叶痴呆(sporadic frontotemporal dementia, FTD)之间的共享遗传信号。研究人员鉴定出五个基因组区域在T2D与至少一种痴呆亚型之间携带共享关联信号。其中,APOE基因座对所有痴呆亚型是共同的,而其余四个基因座(GBA、CRY2/PEX16/MAPK8IP1、INO80E和NSF)各自仅在T2D与一种痴呆亚型之间共享。通过整合多个疾病相关组织的多组学数据和正交功能证据,研究人员优先筛选出26个候选基因,这些共享遗传基因座可能通过这些基因介导其效应。通路富集分析凸显了脂质和脂蛋白调控生物学是核心共享轴。利用相关组织中遗传调控的基因表达进行的孟德尔随机化分析表明,存在具有不同表型后果的多效性机制。这些发现鉴定了T2D与神经退行性痴呆之间的共享遗传基因座,揭示了系统性代谢-神经退行性权衡,并突出了支撑该共病的关键基因,为理解年龄相关的多重疾病提供了一个框架。
在人口老龄化日益加剧的背景下,代谢性疾病与神经退行性疾病之间的关联已成为重要的公共健康问题。2型糖尿病(type 2 diabetes, T2D)与痴呆在老年人中频繁共存,但其共病机制是否源于共享的遗传易感性,而不仅仅是血管效应介导的风险,仍不清楚。为探究这一问题,研究人员基于大规模临床诊断个体的全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS)数据,系统分析了T2D与三种神经退行性痴呆——阿尔茨海默病(Alzheimer disease, AD)、路易体痴呆(Lewy body dementia, LBD)和散发性额颞叶痴呆(sporadic frontotemporal dementia, FTD)之间的共享遗传信号。
既往观察性研究显示T2D与痴呆风险增加相关,但全基因组层面的遗传相关分析并未发现T2D与痴呆之间存在显著的全局遗传相关。研究人员采用连锁不平衡分数回归(linkage disequilibrium score regression, LDSC)和MiXeR多基因重叠分析,发现T2D与FTD之间仅存在有限的多基因重叠,且遗传相关接近零,提示混合方向的多效性而非一致效应。双向两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)分析除确认AD遗传易感性对T2D风险的保护作用外,未发现其他稳健的因果关联。
通过贝叶斯共定位分析(coloc.abf)及条件共定位分析(pairwise conditional and colocalization, PWCoCo),研究人员在T2D与各痴呆亚型之间鉴定出五个共享基因组区域:APOE基因座(与所有三种痴呆亚型共享),以及GBA(LBD)、CRY2/PEX16/MAPK8IP1(AD)、INO80E(LBD)和NSF(FTD)基因座(各与单一痴呆亚型共享)。在共享区域内,研究人员整合了多组学证据进行基因优先排序,包括分子数量性状基因座(molecular quantitative trait locus, QTL)的共定位、差异表达分析、罕见遗传病数据库查询、基因敲除小鼠表型分析及错义变异注释,最终优先筛选出26个候选效应基因。其中,APOE、APOC2、BCAM、CBLC、ERCC1和ERCC2位于APOE区域,16个基因来自LBD-T2D共享区域,NSF来自FTD-T2D共享区域,CRY2、PEX16和MAPK8IP1来自AD-T2D共享区域。
通路富集分析显示,这些优先基因富集于脂蛋白颗粒调控(APOE和APOC2)及损伤DNA结合(CRY2、ERCC1和ERCC2)等生物学过程,提示脂质调控生物学是连接神经退行性痴呆与T2D共病的核心节点。进一步利用循环脂质GWAS数据,研究人员发现APOE区域与所有分析的血脂性状相关,而16号染色体LBD-T2D共享区域与甘油三酯和高密度脂蛋白胆固醇水平相关。对共享区域中具有eQTL共定位证据的优先基因进行的孟德尔随机化分析表明,遗传调控的基因表达对痴呆和T2D风险的影响大多方向相反。例如,INO80E表达升高在多种组织(包括脑区、胰岛、肝脏、脂肪和骨骼肌)中一致地增加LBD风险并降低T2D风险;CRY2在肝脏中表达升高则同时增加AD和T2D风险。
本研究的结论是,T2D与神经退行性痴呆的流行病学共病更符合局部多效性机制和拮抗性遗传权衡,而非广泛共享的多基因易感性或同向致病机制。多个痴呆亚型特异的共享基因座及其优先效应基因对代谢和神经退行性疾病风险表现出相反效应,表明共病由有限数量的生物学信息丰富的基因座驱动。本研究鉴定了T2D与痴呆亚型特异的共享遗传位点,为理解年龄相关多重疾病提供了机制路线图,并为未来设计缓解而非重新分配年龄相关疾病风险的干预措施奠定了基础。