韩国蝙蝠中阿尔法冠状病毒的检测、表征与人畜共患病风险评估

《BMC Veterinary Research》：Whole-genome characterization and zoonotic potential of Alphacoronavirus from greater horseshoe bats (Rhinolophus ferrumequinum) collected on Jeju Island, Republic of Korea, 2009–2014

　　

摘要

背景

阿尔法冠状病毒属（Alphacoronavirus，α-CoV）属于冠状病毒科，包含感染多种哺乳动物宿主的正义单股RNA病毒，常促进跨物种传播。蝙蝠被认为是感染各种哺乳动物（包括貉和啮齿动物）的多种α-CoV的原始宿主库。在韩国，遗传上不同的蝙蝠种群的存在强调了持续病毒监测的必要性，以全面了解冠状病毒的多样性并评估其人畜共患病的潜力。

方法

在2009年至2014年间，在韩国8个省收集了代表15个物种的434个蝙蝠样本。使用巢式逆转录PCR（RT-PCR）对样本进行冠状病毒RNA筛选。阳性样本进一步使用宏基因组下一代测序（mNGS）进行分析，以获得完整的编码序列，随后进行系统分类和基于基因组的初步风险优先级评估。

结果

在434个蝙蝠样本（1.6%）中检测到冠状病毒RNA，所有这些样本均来自济州岛的意大利菊头蝠。成功表征了两个完整的冠状病毒编码序列，并将其归类为α-CoV的Decacovirus亚属。系统发育分析显示，这些分离株与中国发现的蝙蝠冠状病毒有最近的共同祖先。此外，预测溢出评分和结构分析将这些病毒归类为潜在溢出风险的中等优先级。

结论

这些发现凸显了α-CoV的循环，即使在济州岛地理隔离的蝙蝠种群中也存在。此外，它们有助于更广泛地了解东亚蝙蝠传播冠状病毒的遗传和地理多样性。鉴于其初步风险优先级评估，需要持续监测以预测和减轻未来的溢出风险。