VI型分泌系统基因簇在AHPND相关弧菌中的基因组分布及其与PirAB毒素的关联性分析

《BMC Genomics》：Distribution of the type VI secretion systems and the plasmid encoding pirAB genes in Vibrio parahaemolyticus and Vibrio campbellii

　　急性肝胰脏坏死病（AHPND）是影响虾类养殖的最具毁灭性的细菌性疾病之一，在全球范围内造成了严重且持续的经济损失。AHPND由约70 kb质粒编码的双组分毒素PirAB引起。然而，其他细菌因素对AHPND发病机制的潜在贡献仍不清楚。VI型分泌系统（T6SS）是一种保守的细菌纳米机器，参与细菌间竞争和宿主致病性，此前报告称其仅存在于副溶血性弧菌（*Vibrio parahaemolyticus*）的AHPND致病菌株中。我们利用新测序的来自菲律宾虾场（有明确死亡暴发记录）的副溶血性弧菌PH1339和PH1273以及坎贝尔弧菌（*V. campbellii*）PH1401和PH1409，并结合807个公开可用的基因组，对该关联性进行了研究。全基因组分析显示，新测序菌株中存在多个T6SS基因簇——T6SS1、T6SS2和T6SS3。T6SS1存在于AHPND致病菌株PH1339和PH1401中，同时也存在于非AHPND菌株PH1409中。T6SS2在所有四个菌株中均有鉴定，而T6SS3仅在坎贝尔弧菌中检测到。基因组分析显示，所有*pirAB*?菌株均编码T6SS1和T6SS2，而*pirAB*?坎贝尔弧菌菌株还额外编码T6SS3。然而，系统发育感知的共现分析未发现*pirAB*与T6SS基因簇之间存在显著关联，这表明它们所观察到的共现反映了谱系依赖性，而非直接的功能关联。这些发现阐明了T6SS基因簇在AHPND相关弧菌谱系中的分布情况，并为进一步研究其在AHPND发病机制中的潜在作用提供了基因组学框架。