基于2b-RAD-seq和基因组组装方法鉴定长鳍光唇鱼XX/XY性别决定系统及雄性特异性Y染色体标记

《BMC Genomics》：Identification of male-specific markers via 2b-RAD sequencing reveals an XX/XY sex determination system in Acrossocheilus longipinnis

　　

摘要

背景

Acrossocheilus longipinnis（长鳍光唇鱼）是原产于中国西南地区的一种具有重要商业价值的养殖鱼类，因其肉质优良、营养价值高以及富含多不饱和脂肪酸而深受消费者青睐。尽管该物种表现出显著的性别二态性，雌性生长速度明显快于雄性，但其性别决定系统及其潜在机制仍不清楚，这阻碍了单性养殖技术的开发和生产效率的优化。

结果

本研究利用2b-RAD-seq和基因组组装方法，成功在A. longipinnis的XY雄性和XX雌性中鉴定出3个雄性特异性序列。共线性分析和覆盖深度分析将这3个序列定位在5,724,913–5,869,801 bp处的Y染色体特异性插入片段上，并通过PCR扩增在来自2个种群的72个个体中进一步证实了其雄性特异性。

结论

研究结果表明该物种具有XX/XY性别决定系统，并为A. longipinnis的性别控制育种提供了适用的雄性特异性标记。这些发现为该物种未来性别染色体鉴定、性别决定区域（SDR）精细定位以及主性别决定基因（SDG）克隆研究奠定了坚实基础。