
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
胰腺导管腺癌组织中Hippo、NF-κB及干扰素相关信号通路的协同失调及其mRNA生物标志物的外部验证
《BMC Gastroenterology》:Coordinated upregulation of Hippo, NF-κB and interferon pathway genes in pancreatic ductal adenocarcinoma: a retrospective tissue qRT-PCR profiling study with external tumour-versus-non-tumour validation, molecular subtype and survival analyses
【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月24日 来源:BMC Gastroenterology 3.2
编辑推荐:
摘要目标胰腺导管腺癌(PDAC)是最致命的实体瘤之一。Hippo、NF-κB和干扰素(IFN)相关信号通路的改变均已被证明与其生物学特性有关,但这些转录程序在肿瘤组织中协同失调的程度仍不完全明确。因此,本研究旨在确定这些程序是否在PDAC组织中协同上调,以及单个转录本是否能独
胰腺导管腺癌(PDAC)是最致命的实体瘤之一。Hippo、NF-κB和干扰素(IFN)相关信号通路的改变均已被证明与其生物学特性有关,但这些转录程序在肿瘤组织中协同失调的程度仍不完全明确。因此,本研究旨在确定这些程序是否在PDAC组织中协同上调,以及单个转录本是否能独立地、可重复地区分肿瘤组织与非肿瘤组织。
在这项回顾性研究中,我们对50例福尔马林固定石蜡包埋的PDAC标本和35例非肿瘤胰腺组织样本中的17个mRNA靶标进行了实时定量PCR分析,覆盖Hippo通路核心及输出、炎症/IL-6模块、IFN相关轴和NF-κB级联,并使用GAPDH作为内参基因,采用2?ΔΔCt方法进行标准化。通过全队列受试者工作特征(ROC)分析(无重采样)和嵌套交叉验证评估区分能力,并使用Benjamini–Hochberg校正方法检验其与临床病理变量的关联。研究结果在GSE62452和TCGA-PAAD数据集中进行外部验证。
所有17个转录本在PDAC中均显著上调(FDR?0.05),中位倍数变化从3.4倍(WWTR1)到18.4倍(LATS1)不等。MYD88、ANKRD1、ISG15和YY1的区分能力最佳(AUC 0.853–0.911),嵌套交叉验证得出的特征组合AUC为0.890(95% CI 0.821–0.959),仅略优于单基因MYD88。校正后无临床病理变量与转录本丰度相关。在GSE62452数据集(69例PDAC,61例邻近非肿瘤组织)中,8个转录本以一致方向得到重复验证,其中以YAP1(AUC 0.791)、TEAD1(0.760)和MYD88(0.755)表现最突出,固定的四基因发现特征组合保持了区分能力(AUC 0.798,95% CI 0.719–0.877)。重复验证呈基因特异性而非模块整体性:IL6、其余NF-κB转录本及4个Hippo成员未能重复,IFNB1则呈不一致方向。Hippo输出基因在两个外部数据集中均与基底样亚型相关。在TCGA-PAAD数据集中,高YY1表达(HR 2.01;p?=?0.001)和高YAP1表达(HR 1.72;p?=?0.010)预测生存期缩短,但当分析限定于导管型组织学时,这两个关联均失去统计学显著性。
PDAC组织在这四个模块中显示出协同上调,但仅17个转录本中的8个在外部得到重复验证,其中在Hippo效应轴和MYD88中表现最为显著。YAP1、TEAD1、MYD88和STK4的验证AUC超过0.70,优先用于前瞻性研究。由于转录本丰度并不直接反映通路活性,且所有数据均来源于混合组织,这些关联属于假说生成性证据,而非机制性证据。
胰腺导管腺癌(PDAC)是最致命的实体瘤之一。Hippo、NF-κB和干扰素(IFN)相关信号通路的改变均已被证明与其生物学特性有关,但这些转录程序在肿瘤组织中协同失调的程度仍不完全明确。因此,本研究旨在确定这些程序是否在PDAC组织中协同上调,以及单个转录本是否能独立地、可重复地区分肿瘤组织与非肿瘤组织。
在这项回顾性研究中,我们对50例福尔马林固定石蜡包埋的PDAC标本和35例非肿瘤胰腺组织样本中的17个mRNA靶标进行了实时定量PCR分析,覆盖Hippo通路核心及输出、炎症/IL-6模块、IFN相关轴和NF-κB级联,并使用GAPDH作为内参基因,采用2?ΔΔCt方法进行标准化。通过全队列受试者工作特征(ROC)分析(无重采样)和嵌套交叉验证评估区分能力,并使用Benjamini–Hochberg校正方法检验其与临床病理变量的关联。研究结果在GSE62452和TCGA-PAAD数据集中进行外部验证。
所有17个转录本在PDAC中均显著上调(FDR?0.05),中位倍数变化从3.4倍(WWTR1)到18.4倍(LATS1)不等。MYD88、ANKRD1、ISG15和YY1的区分能力最佳(AUC 0.853–0.911),嵌套交叉验证得出的特征组合AUC为0.890(95% CI 0.821–0.959),仅略优于单基因MYD88。校正后无临床病理变量与转录本丰度相关。在GSE62452数据集(69例PDAC,61例邻近非肿瘤组织)中,8个转录本以一致方向得到重复验证,其中以YAP1(AUC 0.791)、TEAD1(0.760)和MYD88(0.755)表现最突出,固定的四基因发现特征组合保持了区分能力(AUC 0.798,95% CI 0.719–0.877)。重复验证呈基因特异性而非模块整体性:IL6、其余NF-κB转录本及4个Hippo成员未能重复,IFNB1则呈不一致方向。Hippo输出基因在两个外部数据集中均与基底样亚型相关。在TCGA-PAAD数据集中,高YY1表达(HR 2.01;p?=?0.001)和高YAP1表达(HR 1.72;p?=?0.010)预测生存期缩短,但当分析限定于导管型组织学时,这两个关联均失去统计学显著性。
PDAC组织在这四个模块中显示出协同上调,但仅17个转录本中的8个在外部得到重复验证,其中在Hippo效应轴和MYD88中表现最为显著。YAP1、TEAD1、MYD88和STK4的验证AUC超过0.70,优先用于前瞻性研究。由于转录本丰度并不直接反映通路活性,且所有数据均来源于混合组织,这些关联属于假说生成性证据,而非机制性证据。