沙特阿拉伯利雅得2010–2025年B型流感病毒分子流行病学与长期进化动态研究

《BMC Infectious Diseases》：Long-term molecular surveillance of influenza B virus in Riyadh, Saudi Arabia (2010–2025): lineage replacement, genetic evolution, and vaccine strain compatibility

　　

摘要

引言

B型流感病毒（IBV）引起季节性流行，并经历持续的遗传进化，可能影响疫苗的有效性。然而，关于沙特阿拉伯IBV分子流行病学和长期进化动态的数据仍然有限。因此，本研究旨在表征2010–2025年间沙特阿拉伯利雅得流通IBV的遗传多样性、进化动态、谱系替换以及与疫苗相关的遗传变化。

方法

2014年至2020年，从利雅得的流感样症状患者中收集了311份呼吸道标本。采用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测IBV，并对完整的HA和NA基因进行测序。记录了核苷酸水平和氨基酸水平的突变。分析了糖基化谱。系统发育比较包括世卫组织疫苗参考毒株、2014–2020年间收集的标本产生的6个IBV分离株，以及2010–2025年间已发表的31个利雅得序列，以评估利雅得IBV的长期谱系动态。

结果

在311份标本中，88份（28.3%）甲型流感阳性，6份（1.9%）IBV阳性。系统发育分析显示2015年存在B/山形谱系病毒，2020年存在B/维多利亚谱系病毒。尽管抗原区域（120环、150环、160环、190螺旋）存在替换，但HA和NA蛋白相对于疫苗毒株高度保守。近期部分B/维多利亚分离株（2023–2025年）携带特征性的164–165位缺失，而B/山形显示谱系特异性糖基化变化。N-连接糖基化位点大部分保守，但部分分离株在HA 197位发生获得/丢失，可能影响抗原性。对2010–2025年间额外已发表的利雅得序列（n = 31）的分析显示B/维多利亚持续占优势（亚支系V1A.3a.2和V1A.3）；在测序分离株中未检测到B/山形谱系病毒。近期毒株与疫苗毒株B/Austria/1,359,417/2021和B/Tokyo/EIS13-175/2025遗传关系密切，仅有有限的氨基酸替换。

结论

利雅得长期监测（2010–2025年）显示，在可用的监测数据集中，B/山形被B/维多利亚谱系病毒所取代。近期分离株（2021–2025年）均属于全球占主导地位的V1A.3a.2亚支系。IBV显示出持续进化，但仍与世卫组织推荐的疫苗毒株密切相关。B/维多利亚的占主导地位以及在可用数据集中未检测到B/山形，强调了持续分子监测的必要性，以监测病毒进化、评估疫苗毒株兼容性，并支持沙特阿拉伯的流感防控工作。