多组学算法匹配评分：晚期癌症精准药物匹配的临床医学评估

《npj Genomic Medicine》：Molecular therapy matching score correlates with clinical outcomes: a system for navigating cancer complexity

　　

摘要

历史上，精准医学意味着将一种生物标志物与相应的单药疗法相匹配。然而，下一代精准肿瘤学必须应对癌症的复杂性。事实上，晚期肿瘤的基因组变异中位数为五个；鉴于约700个致癌基因的存在，产生了超过1万亿种变异模式。我们描述了一种算法匹配评分（在数字推理框架内的专家策展知识库），用于评估抗癌药物/药物组合处理患者整个下一代测序/多组学衍生分子图谱的能力。利用前瞻性、同行评审的已发表临床试验及其他研究结果的回顾性分析，为540例晚期/转移性癌症患者生成了匹配评分（唯一致病性变异数 = 374）；最常见的癌症为乳腺癌（n = 98）和结直肠癌（n = 64）。匹配评分结果通过Kaplan–Meier、单变量和多变量Cox回归分析进行了评估，结果表明匹配评分与无进展生存期显著相关（0%与67–100%匹配：3.0个月 vs. 9.0个月，风险比（HR）：0.34，P < 0.01）、总生存期显著相关（0%与67–100%匹配：9.0个月 vs. 18.7个月，HR：0.54，P < 0.01），以及临床获益率（稳定疾病≥6个月/客观缓解）显著相关（0%与67–100%匹配：22.1% vs. 55.9%，比值比：4.59，P < 0.01）。本研究强调了精准医学方法的临床重要性，即最大化多种分子变异与相应药物的匹配。