综述：埃塞俄比亚结核分枝杆菌基因型多样性与近期传播的系统综述和Meta分析

《European Journal of Medical Research》：Genotypic Diversity and Recent Transmission Patterns of Mycobacterium Tuberculosis in Ethiopia: a Systematic Review and Meta-analysis

　　

摘要

背景

结核分枝杆菌复合群（MTBC）仍然是全球发病率和死亡率的主要原因。尽管其突变率和重组率相对较低，但存在相当大的基因型变异，影响着疾病进展、传播以及耐药性的出现。本系统综述和Meta分析旨在综合有关埃塞俄比亚结核分枝杆菌基因型多样性和近期传播的证据。

方法

在多个电子数据库（包括MEDLINE/PubMed、Web of Science、Google Scholar、Cochrane Library及灰色文献来源）中进行了全面的文献检索。纳入在埃塞俄比亚开展并使用 spoligotyping（串联重复单位分型）、分枝杆菌间隔重复序列可变数串联重复（MIRU–VNTR）或全基因组测序（WGS）对M. tuberculosis进行表征且以英文发表的研究。使用R 4.5.2版进行数据分析，采用随机效应Meta分析、I²统计量进行异质性评估，并进行了亚组分析。

结果

系统综述纳入了24项合格研究，涉及3601例M. tuberculosis分离株。研究中使用spoligotyping、MIRU–VNTR和/或全基因组测序（WGS）对埃塞俄比亚MTBC的多样性及传播模式进行了表征。在分离株中，最常报道的Spoligotype国际型（SITs）为SIT149（14/24，58.3%）和SIT53（12/24，50.0%）。 lineage 4（欧美系）占主导地位，其次是lineage 3（德里/CAS系），这两者是埃塞俄比亚报道的主要MTBC谱系。报道较少的谱系包括lineage 1、2、5以及埃塞俄比亚特有的lineage 7。谱系分布和菌株组成在不同地理区域（包括阿姆哈拉、奥罗米亚和提格雷地区）和研究方法间存在较大差异，反映高度异质性。孤儿菌株比例差异极大，部分研究中高达91.1%。总体汇总的聚集度和近期传播指数（RTI）分别为57%和45%。

结论

本综述显示，埃塞俄比亚结核分枝杆菌存在显著的遗传多样性和持续传播，以lineage 4为主。高聚集度和近期传播率提示结核病（TB）持续传播，且存在显著的地区差异。然而，现有证据碎片化且局限于特定区域，限制了对全国传播动力学的全面理解。加强分子监测和针对性公共卫生干预对于控制持续传播至关重要。

背景

结核分枝杆菌复合群（MTBC）仍然是全球发病率和死亡率的主要原因。尽管其突变率和重组率相对较低，但存在相当大的基因型变异，影响着疾病进展、传播以及耐药性的出现。本系统综述和Meta分析旨在综合有关埃塞俄比亚结核分枝杆菌基因型多样性和近期传播的证据。

方法

在多个电子数据库（包括MEDLINE/PubMed、Web of Science、Google Scholar、Cochrane Library及灰色文献来源）中进行了全面的文献检索。纳入在埃塞俄比亚开展并使用spoligotyping、分枝杆菌间隔重复序列可变数串联重复（MIRU–VNTR）或全基因组测序（WGS）对M. tuberculosis进行表征且以英文发表的研究。使用R 4.5.2版进行数据分析，采用随机效应Meta分析、I²统计量进行异质性评估，并进行了亚组分析。

结果

系统综述纳入了24项合格研究，涉及3601例M. tuberculosis分离株。研究中使用spoligotyping、MIRU–VNTR和/或全基因组测序（WGS）对埃塞俄比亚MTBC的多样性及传播模式进行了表征。在分离株中，最常报道的Spoligotype国际型（SITs）为SIT149（14/24，58.3%）和SIT53（12/24，50.0%）。lineage 4（欧美系）占主导地位，其次是lineage 3（德里/CAS系），这两者是埃塞俄比亚报道的主要MTBC谱系。报道较少的谱系包括lineage 1、2、5以及埃塞俄比亚特有的lineage 7。谱系分布和菌株组成在不同地理区域（包括阿姆哈拉、奥罗米亚和提格雷地区）和研究方法间存在较大差异，反映高度异质性。孤儿菌株比例差异极大，部分研究中高达91.1%。总体汇总的聚集度和近期传播指数（RTI）分别为57%和45%。

结论

本综述显示，埃塞俄比亚结核分枝杆菌存在显著的遗传多样性和持续传播，以lineage 4为主。高聚集度和近期传播率提示结核病（TB）持续传播，且存在显著的地区差异。然而，现有证据碎片化且局限于特定区域，限制了对全国传播动力学的全面理解。加强分子监测和针对性公共卫生干预对于控制持续传播至关重要。