全基因组测序在遗传病基因携带者筛查中的应用：从三级基因面板扩展中检出率的显著提升

《Human Genomics》：Clinical utility of carrier screening using whole genome sequencing (WGS) for reproductive risk assessment

　　

摘要

背景

基因携带者筛查在防止遗传病传播方面具有相当大的潜力。通过评估生殖风险，可以识别出无症状但携带可遗传给后代致病突变的个体。在本研究中，对参加NAGEN项目的1567名个体（398对夫妇）进行了全基因组测序（WGS）。参与者通过包含囊性纤维化、脆性X综合征和脊髓性肌萎缩症的"一级"生殖风险基因面板接受了机会性筛查。随后，对一组149名个体（74对夫妇）接受了辅助生殖治疗的人群使用"三级"扩展基因面板进行了分析，该面板包含美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）推荐的113个与常染色体隐性遗传和X连锁疾病相关的基因。

结果

"一级"分析在6%的个体中发现了致病突变，其中包括两对夫妇，双方均携带CFTR基因的突变，这使他们有可能生育患病后代。将基因面板从3个基因扩展到113个基因虽然带来了分析挑战，但将携带者检出率从6%提高到了40%。这项更广泛的分析发现了一对携带ARSA基因致病突变的夫妇，该基因与异染性脑白质病相关；还发现了一名携带X连锁RS1基因致病突变的女性，该基因与视网膜劈裂症1型相关。所有携带者都被提供了生殖选择方案，包括单基因疾病的植入前遗传学检测（PGT-M）。

结论

携带者检出率的提高凸显了将孕前基因筛查纳入医疗体系的必要性。这种策略可以通过提高携带者意识的认识和提供生殖选择方案，从而减轻孟德尔遗传病的医疗、社会和经济负担。