泛癌分析揭示DIMT1作为人类癌症的预后和免疫相关生物标志物及治疗靶点

《BMC Cancer》：Comprehensive pan-cancer analysis of DIMT1 reveals its prognostic significance and immune-associated characteristics with experimental validation in gastric cancer

　　

摘要

背景

甲基腺苷转移酶 1（DIMT1）是一种参与核糖体生物发生的 rRNA 修饰酶；然而，其跨人类癌症的潜在致癌相关性及免疫相关特征仍未得到完全理解。此处，我们旨在系统表征 DIMT1 在恶性肿瘤中的生物学和临床意义。

方法

通过整合 TCGA 和 GTEx 数据集的转录组、基因组和表观遗传数据，进行了一项全面的泛癌分析。利用多种生物信息学方法系统评估了 DIMT1 的表达模式、预后意义、基因组改变、DNA 甲基化特征以及与肿瘤免疫微环境的关系。进一步在胃癌中进行了功能富集和药物敏感性分析。此外，进行了体外和体内实验，以研究 DIMT1 缺失在胃癌模型中的生物学效应。

结果

DIMT1 表现出主要的核定位，并在多种癌症类型中异常表达。DIMT1 高表达与几种恶性肿瘤的不利生存结果相关。泛癌分析揭示了独特的基因组和表观遗传改变模式，并显示了 DIMT1 表达与免疫浸润谱、免疫调节基因以及特定癌症类型的 TMB/MSI 特征之间存在显著关联。在胃癌中，DIMT1 相关基因富集于与 RNA 代谢、细胞周期调控和免疫相关过程相关的通路。功能验证进一步表明，沉默 DIMT1 显著抑制了体外胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭，并在体内抑制了肿瘤生长。

结论

我们的研究提供了 DIMT1 跨人类癌症的全面表征，并将其鉴定为一种潜在的预后和免疫相关生物标志物。实验验证进一步支持了其在胃癌中的促肿瘤作用，突显了 DIMT1 作为未来治疗研究的候选靶点。