MyeGPT：基于智能体AI的多发性骨髓瘤临床-分子数据分析平台

《BMC Medical Informatics and Decision Making》：MyeGPT: an AI agent for multiple myeloma

　　

摘要

背景

如今，我们对癌症生物学理解的进步越来越多地归功于大规模临床-分子数据集。多发性骨髓瘤——第二常见的血液系统恶性肿瘤——的典型案例是CoMMpass研究，该数据集包含1,143名患者的配对临床数据和测序数据。然而，这一丰富数据集的复杂性——包含763个临床参数以及分布在超过20个文件中的汇总数据——给希望提出简单查询的临床研究者带来了障碍，例如"VRD诱导治疗后有多少百分比的患者复发？"或"比较NSD2高表达与正常表达患者的总生存期"。

方法

近年来，智能体AI的兴起为弥补这一技术差距带来了前所未有的机遇。我们开发了MyeGPT，一个用于多发性骨髓瘤临床-分子分析的AI智能体。基于推理-行动（ReAct）框架，我们的智能体将自然语言转化为基于CoMMpass数据集的新颖分析，执行统计分析，并生成出版质量的图表。为了验证，我们创建了一个包含20个计算密集型问题的基准测试集，并设计了两个基于已发表结果的问题。

结果

MyeGPT在内部基准测试上取得了79.4%的平均推理-准确性综合评分，并与人类生物信息学家达到了\(\:\kappa\:=0.965\)的评分者间一致性。它还能够以近乎完美的精度重现已发表的研究结果。我们将该智能体部署为一个即用型浏览器应用程序，使研究人员可以从智能手机上进行随时随地的假设验证。

结论

MyeGPT展示了智能体AI如何消除分析CoMMpass等大型多组学数据集所需的繁琐脚本编写工作。通过提高从单变量统计到全转录组假设检验等各种分析的可用性，MyeGPT可以加速多发性骨髓瘤的临床队列验证和假设生成。

临床试验编号

不适用。