整合血浆来源的循环蛋白与多组学方法以识别食管腺癌的潜在治疗靶点——可供购买

《Analytical Methods》：Integrating plasma-derived circulating proteins with multi-omics approaches to identify potential therapeutic targets for esophageal adenocarcinomaAvailable to Purchase

　　**摘要****背景**：食管腺癌（EAC）是一种复杂疾病，通常先于Barrett食管出现。**目的**：本研究旨在鉴定潜在的药物治疗靶点，并支持早期预防和治疗。**方法**：我们利用孟德尔随机化方法，整合了35,559名个体的cis蛋白数量性状位点（cis-pQTLs）和全基因组关联研究（GWAS）数据以推断因果关系，并应用了FDR校正。为评估组织相关性，在三类GTEx v8食管组织中检验了来源cis-pQTL工具变量，随后对CD55和NDST1进行了组织信息单变异体Wald分析。采用基因本体论（GO）和KEGG通路分析以及蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络分析来探索生物学功能和相互作用。通过GEO数据库的差异表达分析鉴定了重叠基因。利用XGBoost和Lasso回归筛选关键特征基因，并通过训练集和验证集中的ROC曲线AUC评估诊断性能。免疫浸润分析探讨了肿瘤微环境，分子对接评估了药物潜力。**结果**：我们鉴定了28种与EAC因果相关的血浆蛋白。KEGG分析显示氧化应激和炎症相关通路的富集。转录组验证确认了三个重叠基因。CD55和NDST1在Lasso和XGBoost筛选后成为具有强诊断准确性的关键标志物。大多数显著的食管SNP-组织关联在方向上与相应的血浆pQTL效应一致，且CD55和NDST1的组织特异性Wald估计值与主要的血浆基础研究结果一致。免疫浸润分析显示EAC中免疫细胞组成发生显著变化，特别是自然杀伤细胞、浆细胞和肥大细胞。药物预测和对接结果支持了这些靶点的可药性。**结论**：CD55和NDST1是EAC的有前景的治疗候选靶点。基于这些遗传发现开发的药物有望提高临床试验成功率并降低成本。---**视觉摘要**食管腺癌（EAC）是一种复杂疾病，通常先于Barrett食管出现。---? 2026 作者。由英国皇家化学会出版。使用前必须申请权限；关于在RSC许可下发表的文章中重新使用材料的指导，请参阅：https://www.rsc.org/rsc-licence