《Veterinary Microbiology》:Spatial Analysis and Molecular Typing of
Corynebacterium pseudotuberculosis in Korean Native Goats Show a Cohesive Lineage with Distributed Multidrug Resistance
编辑推荐:
•在35种耐药类别模式中,33.6%的分离株表现为多重耐药(MDR)。•农场级LISA识别出一种高-低型(HL)、一种低-高型(LH)和一种低-低型(LL)空间模式。•皮尔逊相关性分析表明,郡/市区级的CLA流行率与MDR呈正相关。•MLST显示出一个具有凝聚性、当地多样化的
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在35种耐药类别模式中,33.6%的分离株表现为多重耐药(MDR)。
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农场级LISA识别出一种高-低型(HL)、一种低-高型(LH)和一种低-低型(LL)空间模式。
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皮尔逊相关性分析表明,郡/市区级的CLA流行率与MDR呈正相关。
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MLST显示出一个具有凝聚性、当地多样化的谱系,其MDR呈分布状态。
引言
酪素性淋巴结炎(CLA)是一种由副结核分枝杆菌(Corynebacterium pseudotuberculosis)引起的小反刍动物(尤其是山羊)慢性持续性疾病。该菌是一种革兰氏阳性兼性胞内细菌,能在淋巴结和内脏器官中产生特征性脓肿(Parin等,2018)。该病通过降低胴体价值和生产力以及在群体中持续存在的慢性感染动物造成重大经济损失(Minozzi等,2017)。在韩国,血清学研究表明,韩国本土山羊(KNG)中普遍暴露于C. pseudotuberculosis(Jung等,2015),而尸检监测发现近20%的受检山羊存在与CLA相符的病变(Aftabuzzaman等,2023)。由于亚临床感染和内脏病变可能逃脱常规检测,CLA在农场层面的负担可能被低估。
尽管已在KNG中报告了CLA,但分子流行病学和抗菌药物耐药性数据仍然有限。早期的韩国研究主要集中在血清学暴露、临床相关性或病变分布(Jung等,2015;Aftabuzzaman等,2023),而对C. pseudotuberculosis分离株进行分子表征或评估抗菌药物敏感性的研究很少(Pathirana等,2022)。抗菌药物耐药性(AMR),包括对四环素类、大环内酯类和β-内酰胺类(这些类别用于小反刍动物细菌病管理)的耐药性,已在其他养羊地区的C. pseudotuberculosis中被报告(Abebe和Sisay Tessema,2015;El Damaty等,2023)。多重耐药性(MDR)可能进一步使疾病管理复杂化(Abreu等,2008),然而KNG分离株中的MDR模式仍未得到充分表征。
分子流行病学方法可提供关于C. pseudotuberculosis群体结构的补充信息。多位点序列分型(MLST)和其他基因分型方法已证明了遗传异质性,包括在群体内部和群体之间传播的密切相关的序列型(Schlicher等,2021)。这些方法有助于评估基因型、地理和耐药表型之间的关系(Taha,2022;Khanamir等,2023)。包括来自澳大利亚、巴西和欧洲国家的分离株的研究已证明了地理上多样化的C. pseudotuberculosis群体之间的遗传相关性(Connor等,2007;Soares等,2013)。KNG的可比分子数据仍然有限(Pathirana等,2022)。
韩国山羊CLA和MDR的空间流行病学也知之甚少。分子研究已证明了来自不同群体和地理来源的C. pseudotuberculosis分离株之间的关系(Connor等,2007;Schlicher等,2021),但韩国尚未评估耐药分离株的空间分布。早期研究考察了各地区的血清学暴露(Jung等,2015)和特定农场内CLA的发生(Aftabuzzaman等,2023),但未评估MDR的空间聚类或AMR谱相似度与地理距离之间的关系。因此,本研究表征了KNG来源的C. pseudotuberculosis分离株中的抗菌药物耐药性和MDR模式,利用五位点MLST评估了遗传关系,并评估了MDR的空间分布。空间分析进一步考察了全局和局部MDR模式、CLA流行率与MDR之间的关系,以及地理距离与AMR谱相似度之间的关联。
章节摘要
样本采集与分离株确认
共对全罗地区110个农场的1,177只韩国本土山羊(KNG)在屠宰时进行了CLA检查。该监测群体的农场级CLA流行率数据、病变发生情况、宿主相关危险因素以及初始细菌鉴定已先前报告(Aftabuzzaman等,2023;Pioquinto等,2023)。简而言之,在全罗北道淳昌郡和全罗南道和顺郡的农场中观察到中等至高度的CLA发生。病变为
抗菌药物敏感性与MDR
所有286株从CLA病变中分离并确认的C. pseudotuberculosis分离株均针对代表10个主要药物类别的12种抗菌药物进行了药敏试验。耐药性广泛存在,但在不同抗菌药物之间差异较大(图1A)。氨基糖苷类显示出最高的耐药率,几乎所有分离株对链霉素耐药(99.7%),大多数对庆大霉素耐药(88.1%)。红霉素(30.8%)、四环素(25.9%)和诺氟沙星(18.5%)也观察到耐药性,
讨论
本研究首次对KNG来源CLA相关C. pseudotuberculosis的AMR、空间分布和分子分型进行了整合分析。综合结果表明,MDR普遍存在,具有局部异质性,且分布在一个遗传上具有凝聚性的群体中,而非局限于单一的优势耐药克隆。
结论
本研究为KNG来源CLA相关C. pseudotuberculosis的AMR、空间分布和分子相关性提供了整合基线数据。耐药性以氨基糖苷类为主,MDR普遍存在,影响了33.6%的分离株。MDR流行率在不同农场和郡/市区单位之间高度异质,支持了一种以农场为条件的耐药负担模式。空间分析进一步识别出农场层面一个高-低型离群值、一个低-高型离群值和一个低-低型聚类,并具有
伦理与动物福利声明
本研究未涉及活体动物实验。所有观察和样本采集均在常规屠宰检验过程中于死后进行,期间对羊胴体检查是否有与CLA相符的病变。未因本研究目的而处理、约束、治疗或安乐死任何动物,也未进行超出标准屠宰场检验范围的额外操作。样本仅从屠宰时发现的胴体/病变中获取。
资金
本文受2025年顺天乡国立大学全球大学项目基金支持。(资助编号:2025-G045)资助方在研究设计、数据收集、分析、解释、手稿撰写或提交文章发表的决策中未发挥任何作用。
CRediT作者贡献声明
Hector M. Espiritu:撰写–审阅与编辑、撰写–原始草稿、可视化、方法学、调查、正式分析、数据管理、概念化。Yongil Cho:撰写–审阅与编辑、监督、资源、项目管理、获取资金。Jae-Ik Han:撰写–审阅与编辑、资源、调查。Pioquinto Jaylord:撰写–审阅与编辑、撰写–原始草稿、可视化、方法学、调查、正式分析、数据管理,
生成式AI与AI辅助技术在写作过程中的声明
ChatGPT(OpenAI;GPT-5,2025年10月;GPT-5.5 Thinking,2026年5月;GPT-5.6 Sol,2026年9月11日)仅用于语言润色、组织和一致性检查。未用于生成或分析数据,也未用于创建或修改主要实验图像;所有数据可视化和统计输出均源自作者的分析和验证。所有AI辅助文本均经作者审阅和验证。
利益冲突声明
作者声明不存在已知的可能影响本文所报告工作的竞争性经济利益或个人关系。
Hector M. Espiritu | Jaylord M. Pioquinto | Jae-Ik Han | Yongil Cho