摘要
背景
重度哮喘以持续性气道炎症为特征，且对生物制剂治疗存在异质性反应。越来越多的证据表明肠-肺轴在哮喘病理生理过程中发挥作用；然而，目前尚无研究同时表征肠道和呼吸道微生物组与重度哮喘治疗反应之间的关系。
方法
我们对48例接受度普利尤单抗治疗的重度哮喘患者的粪便细菌（STB）、粪便来源细胞外囊泡（STE）和呼出气冷凝液（EBC）中的微生物组进行特征分析。根据样本类型和治疗反应进行纵向比较，分析了微生物组成、α多样性及预测的功能谱。同时评估了微生物特征与哮喘相关临床指标之间的关联。
结果
在不同生物区室中鉴定出不同的分类学及预测功能特征。EBC样本中富集了变形菌门，包括假单胞菌属，且与双组分系统和细菌分泌系统相关的通路预测丰度较高。EBC微生物多样性与基线痰嗜酸性粒细胞水平呈正相关（p = 0.018），而粪便微生物丰富度与治疗后的血嗜酸性粒细胞计数存在时间依赖性关联（交互作用p = 0.023）。治疗反应者粪便相关谱中瘤胃球菌属丰度较低（STB q = 0.046；STE q = 0.042），大肠杆菌-志贺菌丰度较低（STE q = 0.038），且旋转螺旋菌科NK4A214群的相对丰度较高（STB q = 5.5 × 10?7，STE q = 1.4 × 10?8）。
结论
肠道和呼吸道来源的微生物组在重度哮喘中似乎发挥互补作用。粪便来源的微生物特征可能反映与治疗反应相关的全身性炎症信号，而呼吸道来源的微生物谱则反映局部气道炎症。整合多区室微生物组数据可能有助于理解重度哮喘患者对生物制剂治疗反应的异质性。
图形摘要
本研究探讨了多区室微生物组特征与度普利尤单抗反应之间的关联。粪便细胞外囊泡中大肠杆菌-志贺菌的相对丰度与后续度普利尤单抗反应以及同期IgE和FeNO水平相关。在非反应者中，粪便细菌和粪便细胞外囊泡中的大肠杆菌-志贺菌丰度的相关性比在反应者中更为显著。EVs，细胞外囊泡；FeNO，呼出气一氧化氮分数；IgE，免疫球蛋白E；PRISM，重度哮喘精准医学干预。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
数据可用性声明
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