长读长RNA测序揭示体细胞重编程中Snhg26异构体转换对获得多能性的关键作用

《Nature Communications》：Long-read RNA sequencing identifies non-coding isoform switching as a regulator of cell fate

　　

摘要

长读长RNA测序技术的发展为探索RNA异构体的多样性及其在调控细胞命运中的意义奠定了基础。然而，鉴定新的功能异构体仍然非常困难。在此，我们利用长读长RNA测序研究体细胞重编程过程中异构体的变化，并鉴定出在细胞状态转换过程中出现的新异构体。我们证明非编码异构体受到严格调控，并表明异构体转换在基因调控和细胞命运变化中发挥着此前被忽视的功能作用和结果。我们发现了一种新型长链非编码RNA Snhg26，它在重编程过程中经历异构体转换，从而增强分化细胞向多能状态的转化。在小鼠和人类多能性模型中敲低Snhg26表明它对获得多能性至关重要。总之，我们的研究为研究细胞命运变化期间全长异构体的使用提供了资源。它还展示了长读长测序在细胞可塑性背景下鉴定功能相关基因异构体方面的能力。