TRAM促进无Toll样受体的myddosome信号转导

《Nature》:TRAM promotes Toll-like-receptor-free myddosome signal transduction

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年09月25日 来源:Nature 56.1

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  在Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)信号转导通路中,活化受体仅存在于初始的膜近端信号复合体(称为原myddosome,proto-myddosome)内数分钟。原myddosome迅速从TLR上释放,自组装(即成熟)为富含酶的胞质超

  
在Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)信号转导通路中,活化受体仅存在于初始的膜近端信号复合体(称为原myddosome,proto-myddosome)内数分钟。原myddosome迅速从TLR上释放,自组装(即成熟)为富含酶的胞质超分子组织中心,称为myddosome。myddosome诱导持续数小时的炎症基因表达。控制原myddosome释放的机制及其对信号转导的影响此前尚未明确。本研究鉴定了调控原myddosome成熟为无受体胞质myddosome过程的因子。通过巨噬细胞遗传筛选,研究人员鉴定出TRAM——此前被描述为调控MyD88非依赖性TLR信号——是myddosome组装的调控因子。利用生物化学、活细胞成像和重组蛋白活性重建,研究人员证明,质膜相关接头蛋白TIRAP引发原myddosome形成后,TRAM使MyD88从TLR–TIRAP复合物中解离,从而促成myddosome成熟和下游信号转导。在缺乏TRAM的情况下,MyD88无法从TLR–TIRAP复合物上解离,导致MyD88与下游信号酶发生异常且不稳定的相互作用。这些发现使研究人员能够将TRAM依赖性长效myddosome活性确定为TLR通路两个标志性特征的 determinants:持续数小时的NF-κB活化和次级反应基因表达。化学解离胞质myddosome可破坏TLR刺激细胞在体外和体内的既有炎症活性。总之,这项工作确立了TRAM作为myddosome成熟和信号转导调控因子的作用,为无受体信号转导提供了分子基础。
**论文解读:TRAM作为myddosome成熟调控因子的发现及其在无Toll样受体信号转导中的作用**

**1. 研究背景、现存问题与研究目的**

Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)是一类跨膜模式识别受体,通过识别病原体相关分子模式(pathogen-associated molecular patterns,PAMPs)和损伤相关分子模式(damage-associated molecular patterns,DAMPs)启动固有免疫应答,被视为炎症和适应性免疫的守门人。经典受体信号转导观点认为,TLR活化后其胞质尾区直接作为支架组装信号复合物。然而,近期研究发现了一种非经典机制:活化TLR仅短暂地(数分钟内)参与初始的膜近端信号复合物——原myddosome(proto-myddosome),随后原myddosome从受体释放进入胞质,自组装(成熟)为富含酶的超分子组织中心——myddosome,进而驱动持续数小时的炎症基因表达。尽管这一受体游离状态的信号转导机制具有重要意义,但控制原myddosome从TLR释放的关键因子及其对信号转导的调控机制此前完全未知。本研究旨在通过系统性遗传筛选和深入的机制解析,鉴定调控myddosome成熟过程的分子开关,揭示无受体信号转导的分子基础。

**2. 研究人员开展的研究、主要结论与意义**

研究人员建立了基于流式细胞术侧向散射(side scatter,SSC)的分选策略,从全基因组CRISPR筛选中鉴定出TRAM(由Ticam2基因编码)作为myddosome组装的正调控因子。TRAM此前主要被认为在TLR4内体途径中介导TRIF依赖性信号,但本研究揭示了其全新功能:TRAM在质膜上促使MyD88从TLR–TIRAP复合物解离,从而释放原myddosome并使其成熟为胞质myddosome。在TRAM缺失时,MyD88与TLR–TIRAP复合物异常持续结合,形成的MyD88复合物不稳定,导致信号过早终止,NF-κB活化时间显著缩短,次级反应基因(secondary response genes,SRGs)表达受损。通过TIRAP:TRAM比例调控实验、体外重组蛋白活性重建和药理学myddosome解离实验,研究证实TRAM介导的myddosome成熟是TLR通路持久信号活性的决定因素。体内实验进一步表明,化学破坏myddosome可在小鼠中有效抑制炎症因子产生。该研究将TRAM确立为myddosome成熟的重要调控因子,为无受体信号转导提供了分子基础,拓展了受体信号转导机制的理论框架。该论文发表在《Nature》。

**3. 主要关键技术方法**

研究人员使用了以下关键技术手段:(1)全基因组CRISPR筛选:利用Julianna sgRNA文库转导MyD88–AGF iBMDMs(含NF-κB荧光报告基因和Cas9),通过SSC分选富集myddosome组装缺陷细胞;(2)流式细胞术分选结合RNA-seq分析:分离应答细胞(responders)和旁观细胞(bystanders)并比较转录组;(3)活细胞显微成像:包括共聚焦、全内反射荧光(total internal reflection fluorescence,TIRF)显微镜和荧光漂白后恢复(fluorescence recovery after photobleaching,FRAP);(4)生物化学分析:时间分辨免疫共沉淀(co-immunoprecipitation,co-IP)和免疫印迹;(5)重组蛋白体外表征:纯化TIR结构域蛋白并测定其形成浊度颗粒(turbidity-causing particles,TCPs)的能力;(6)体内药理学实验:对C57BL/6N小鼠腹腔注射TSI-13-57。样本来源包括iBMDMs(永生化骨髓来源巨噬细胞)、原代BMDMs(来自野生型WT和Ticam2?/?小鼠,C57BL/6J背景)以及C57BL/6N小鼠。

**4. 研究结果**

**Myddosomes drive TLR gene programs(myddosome驱动TLR基因程序)**:通过流式分选和RNA-seq分析,研究人员发现LPS刺激后SSChigh细胞(应答细胞)含有myddosome,其转录组与整体LPS处理细胞相似,选择性诱导初级反应基因(primary response genes,PRGs)和次级反应基因(SRGs),而SSClow旁观细胞缺乏myddosome且不能有效诱导TLR反应基因。细胞因子染色证实仅应答细胞产生IL-6和TNF。此结果表明,含有myddosome的细胞是LPS诱导转录程序的主要来源。

**TRAM regulates myddosome assembly(TRAM调控myddosome组装)**:全基因组CRISPR筛选在LPS和LTA刺激条件下均鉴定出Ticam2(编码TRAM)为高排名候选基因。在TRAM缺陷(?Ticam2)细胞中,MyD88复合物滞留在质膜上,无法形成胞质myddosome,而TIRF显微镜定量显示原myddosome在?Ticam2细胞中持续存在且不再增大。这提示TRAM控制原myddosome的释放和myddosome组装。

**TRAM directs myddosome maturation(TRAM指导myddosome成熟)**:时间分辨免疫共沉淀显示,在WT细胞中原myddosome(MyD88–TIRAP–TLR4复合物)在数分钟内转变为myddosome(MyD88–IRAK–TRAF6复合物),而?Ticam2细胞中MyD88与受体/接头蛋白的异常相互作用持续数小时且复合物不稳定。TRAM以独特的时间动力学与MyD88结合,介导原myddosome从受体释放和随后的成熟过程。

**TRAM enables durable TLR signalling(TRAM支持持久TLR信号)**:免疫印迹和活细胞p65–mScarlet3成像显示,?Ticam2细胞能启动TLR诱导的信号通路,但NF-κB和TBK1活性提前终止,NF-κB核易位失去持续性,仅保留首个活性峰。RT–qPCR和ELISA证明?Ticam2细胞中Tnf和Il6表达显著降低,且此效应大部分不依赖TRIF。原代Ticam2?/? BMDMs验证了这些发现。RNA-seq分析显示Ticam2?/?细胞在6小时回到接近基线,SRGs未被激活。这说明myddosome稳定性对于持久信号和SRG表达至关重要。

**Pathway specificity of TRAM function(TRAM功能的通路特异性)**:利用多种PAMP刺激原代和永生化巨噬细胞,发现TRAM对质膜定位的TLR(TLR2/4)诱导的TNF、IL-6和IL-12p40分泌是必需的,而对TLR3、STING或RIG-I依赖的IFNβ/IP-10分泌无显著影响。IL-6和IL-12p40对TRAM缺失最为敏感。细菌感染实验表明,TRAM缺失巨噬细胞在感染大肠杆菌或金黄色葡萄球菌后IL-6产生减少,但TNF受影响较小。TRAM功能具有TLR通路和细胞因子特异性。

**Plasma membrane TRAM releases MyD88(质膜上的TRAM释放MyD88)**:?Ticam2 iBMDMs中回补TRAM野生型或突变体(G2A、3X、E180A、C114H、D88A/E89A)的实验显示,仅TRAM WT和E180A能支持原myddosome释放和TNF/IL-6分泌。用Fyn、Lyn或TIRAP质膜结合基序替换TRAM N末端构建嵌合体,发现仅含有TIRAP质膜结合基序的嵌合体(TIRAPPBM–TRAM)能恢复myddosome释放和IL-6分泌。3D显微镜定量显示,TRAM WT在富含磷脂酰肌醇4,5-二磷酸(PI(4,5)P2)的质膜微域中富集,而TIRAPPBM–TRAM富集程度与TIRAP类似。这表明质膜PI(4,5)P2富集微域中的TRAM池负责促进myddosome成熟。

**TIRAP:TRAM ratio controls MyD88 activity(TIRAP:TRAM比例控制MyD88活性)**:利用CRISPRa系统激活内源性Tirap或Ticam2基因表达,结果显示TIRAP表达升高模拟了?Ticam2表型(MyD88滞留在质膜、IL-6分泌减少),而TRAM表达升高无此效应。更重要的是,同时上调TRAM可恢复IL-6分泌,且无论二者表达水平多高,只要比例恢复正常即可。质谱分析先确定了内源性TIRAP的N末端序列。此项表明,PI(4,5)P2富集微域中TIRAP:TRAM的比例是决定MyD88活性的关键因素。

**TRAM displaces TIRAP from MyD88(TRAM将TIRAP从MyD88置换出来)**:串联动力学免疫沉淀显示MyD88先与TIRAP结合(10分钟),随后同时结合TIRAP和TRAM(20分钟),最终仅与TRAM结合(40分钟),并在20分钟时检测到MyD88–TIRAP–TRAM三元复合物。用离子霉素耗竭PI(4,5)P2可将MyD88从质膜释放,但MyD88与TIRAP的相互作用仍保持且复合物不能成熟。体外重组蛋白实验证明,TIRAPTIR抑制MyD88TIR自组装(浊度降低>80%),而TRAMTIR单独无作用,但三者的TIR结构域混合时TRAMTIR逆转了TIRAPTIR的抑制作用。TIR结构域足以在体外重现这些功能,TRAM通过置换TIRAP解除对MyD88自组装的限制。

**Myddosome disruption terminates TLR signalling(myddosome解离终止TLR信号)**:使用MyD88TIR自组装抑制剂MPP处理已形成myddosome的细胞,发现MPP能以约30分钟的半衰期解离myddosome,且FRAP实验证明MPP abolished MyD88的动态交换。MPP处理导致NF-κB、MAPK和TBK1活性提前终止,Tnf和Il6转录及分泌减少。时间梯度实验显示MPP在刺激后2小时内添加可抑制TNF分泌,而在4小时后添加仍能抑制IL-6。长寿命的myddosome是TLR通路持续性信号所必需的。

**TSI-13-57 disrupts myddosomes in vivo(TSI-13-57在体内解离myddosome)**:小鼠腹腔注射LPS或LTA后,给予TSI-13-57(MPP衍生物)。免疫沉淀实验证实了PAMP诱导的myddosome在体内形成,TSI-13-57给药可破坏myddosome且不影响MyD88丰度。处理组小鼠血清中IL-6和IL-12p40在4.5小时显著降低,而LPS诱导的ISG表达不受影响,证明该效应是MyD88通路特异性的。体内实验结果证实长寿命myddosome对持续炎症因子产生具有重要意义。

**5. 讨论与结论**

基于上述发现,研究人员提出TLR通路是无受体信号转导的一个范例。与经典观点中受体作为信号复合物核心组分的模式不同,TLR通路中的myddosome在受体游离状态下才能有效发挥功能。该系统自组装阈值在受体释放后达到最大,实现了胞质信号放大,从而支持TLR通路特有的长时间信号和转录活性。这与IL-1R信号形成对比:IL-1R中受体锚定的myddosome产生与受体占据成比例的输出信号。研究结果为受体解离提供了不同于传统认知的功能视角——受体解离并非仅仅终止信号,而是启动信号的有效放大和持续。从机制上,TRAM促进原myddosome从受体复合物释放是一个关键发现,TRAM同时具有经TLR4介导TRIF信号的功能,这两种功能由不同的细胞器介导,这解释了TRAM同时存在于质膜和内体中的现象。研究结论是:TRAM是myddosome成熟和信号转导的重要调控因子,通过将原myddosome从TLR–TIRAP复合物中释放,使其成熟为胞质myddosome并维持持久信号活性,为无受体信号转导提供了分子基础。这些发现拓展了对信号转导机制的理解,并引发了关于是否存在其他类似信号策略的思考。
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