表观遗传加速预测的多领域因素分析：健康行为的主导作用

《npj Aging》：Integrating social, lifestyle, and genetic profiles to predict epigenetic age acceleration in older adults

　　

摘要

表观遗传加速（EAA）与社会、生活方式和行为暴露有关，但当将它们同时考虑时，它们之间的相对重要性仍然不清楚。为了解决这一空白，我们采用综合、多领域的方法，比较人口统计、社会经济、社会心理、健康行为、临床和遗传因素在预测EAA时的相对重要性。在这项横断面研究中，我们分析了4018名健康与退休研究的参与者，并使用LASSO、随机森林和XGBoost预测不同表观遗传时钟的EAA。为了识别关键预测因子并量化各领域的贡献，我们拟合了全预测因子模型，并训练了仅包含特定领域的模型、消融模型和置换模型。在全预测因子模型中，GrimAge显示出最高的可预测性（5折交叉验证R2 = 0.41），其次是DunedinPoAm（R2 = 0.20），而Hannum、Horvath和PhenoAge几乎未显示出信号。总体而言，GrimAge和DunedinPoAm EAA的预测信号集中在健康行为领域，主要反映吸烟相关信号，身体活动、性别、家庭平均收入和非洲裔血统的贡献较小。