DNA提取方法对端粒长度测量准确性的影响：磁珠法、盐析法与硅胶膜法的系统评估

《Scientific Reports》：DNA extraction methods influence telomeric DNA integrity and bias telomere length measurements

　　

摘要

准确的端粒长度测量对于研究端粒动力学在人类疾病中的作用至关重要。然而，分析前因素对测量精度的影响仍不清楚。在此，我们使用高分辨率单端粒检测方法 DNA-array-FISH，系统评估了常用 DNA 提取方法对端粒长度测量的影响。使用代表三大主要 DNA 提取原理的四种商业试剂盒，从人血样中提取了基因组 DNA：磁珠法、盐析法和硅胶膜法。与盐析提取相比，磁珠法产生了显著更短的平均端粒长度，增加了短端粒（< 2 kb）的频率，并降低了长端粒（> 10 kb）的频率，表明尽管回收了高分子量基因组 DNA，但端粒区域受到了选择性破坏。相比之下，硅胶膜法提取仅导致短端粒比例出现轻微但具有统计学意义的增加。这些发现确定 DNA 提取方法是端粒测量准确性的关键决定因素，并强调了控制分析前变量对于确保研究和临床应用中端粒长度评估的可靠性的重要性。