《Preventive Veterinary Medicine》：H5N1 Epidemiology and Production Impact in Eight California Dairy Herds at the Outbreak Epicenter
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2024年，美国奶牛中出现了高致病性禽流感（Highly Pathogenic Avian Influenza, HPAI）H5N1病毒（分支2.3.4.4b，基因型B3.13），这是一起影响动物健康、生产和公共卫生的新型疫病事件。研究人员对加州图莱里县（Tu
2024年，美国奶牛中出现了高致病性禽流感（Highly Pathogenic Avian Influenza, HPAI）H5N1病毒（分支2.3.4.4b，基因型B3.13），这是一起影响动物健康、生产和公共卫生的新型疫病事件。研究人员对加州图莱里县（Tulare County）——2024年疫情震中——的8家H5N1阳性奶牛场的管理者进行了结构化访谈，涵盖30天参考期、首次隔离期、隔离解除后30天，以及两家奶牛场的第二次隔离期。鉴于样本量较小，研究人员采用描述性统计，并结合多重因子分析（Multiple Factor Analysis, MFA）和层次聚类（hierarchical clustering）来探索牛群异质性。平均产奶量在隔离早期小幅下降（2.6%），至解除隔离时已恢复至基线以上；体细胞数（somatic cell count, SCC）上升21%并持续偏高。四分之三的奶牛场报告乳汁外观异常，所有奶牛场均出现采食量下降（约8%）和妊娠损失，泌乳牛死亡率为1.5%。生物安全改进主要是被动应对而非预防性的。探索性多变量分析识别出两个潜在维度和三种不同的牛群特征，其在生产、临床过程和生物安全强度上存在差异。本研究表明，H5N1感染与生产、乳腺健康和繁殖的可衡量但存在变异的影响相关；研究结果与其他州报告一致，但需在更大规模、更多样化的研究中加以确认。
本研究围绕2024年美国奶牛中暴发的高致病性禽流感（HPAI）H5N1（分支2.3.4.4b，基因型B3.13）展开。历史上，牛不被视为甲型流感病毒（Influenza A virus, IAV）的天然宿主；2024年该病毒在美国多州奶牛群中确认并迅速扩散至加州，截至2024年9月，加州超过200个奶牛群检测阳性，占全美确诊病例70%以上。感染牛出现厌食、呼吸道症状、产奶量骤降、异常乳及繁殖障碍，且病毒具有人畜共患风险；然而，关于牛群管理实践、临床进程和生物安全应对的定量现场数据仍然有限。为此，研究人员开展了这项位于疫情震中的病例系列研究，旨在记录加州早期受影响奶牛群的流行病学与生产特征，并利用多元统计方法探索牛群异质性。
研究人员对加州图莱里县（Tulare County）8家经美国农业部动植物卫生检验局（USDA-APHIS）奶罐奶检测确认H5N1阳性的奶牛场进行了回顾性结构化访谈，覆盖30天参考期、首次隔离期、解除后30天以及两家场的第二次隔离期。结果发现：产奶量隔离早期下降2.6%，解除隔离后恢复并高于基线14%；体细胞数（SCC）上升约21%并持续偏高；75%的场出现异常乳汁，所有场报告采食量下降约8%和妊娠损失，泌乳牛死亡率为1.5%；生物安全改进以反应性为主。多重因子分析（MFA）和主成分层次聚类（HCPC）识别出三个不同特征的牛群图谱。该研究首次提供了疫情震中牛群层面的定量数据，表明外部暴露与牛群管理共同影响疫情结局，可为风险导向的生物安全措施提供依据，但结论需在更大规模、更多样化的样本中验证。
研究方法上，研究人员以加州图莱里县8家H5N1阳性奶牛场为样本（方便抽样，经USDA-APHIS奶罐奶检测确认，通过专业网络和兽医联系人招募）。培训人员对场主或管理者进行了结构化面对面访谈；问卷含111个条目、10个部分；生产数据（产奶量、干物质采食量、体细胞数）以奶牛场电脑记录核实，管理与临床信息由生产者报告。数据分析使用Stata 15和R 4.3.2；先进行描述性统计，再运用多重因子分析（MFA）降维，继以主成分层次聚类（HCPC）进行牛群分型。该设计用于在极小样本中描述异质性，而非进行推断性统计。
研究结果如下：
3.1 牛群特征：8个场分别位于Pixley（3）、Porterville（2）、Tulare（2）、Tipton（1）；平均泌乳牛数为2163±472
