引言
高血脂是一种以脂质代谢紊乱为特征的代谢性疾病,通常表现为血浆总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平异常升高,或高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平异常降低(Pirillo et al., 2021; Sun et al., 2025)。高血脂与心血管疾病、中风、2 型糖尿病及其他代谢障碍密切相关(Chang, Liu, et al., 2025)。其相关并发症涉及多种炎症通路,如动脉粥样硬化病变中的炎症反应(Bao et al., 2020),突显了对有效脂质调节干预措施的迫切需求。此外,血管并发症如主动脉夹层也与代谢紊乱引起的平滑肌细胞功能障碍密切相关(Pu et al., 2025)。因此,血脂异常已成为一项重要的全球公共卫生威胁(Wang, Guo, et al., 2025)。
目前,他汀类和贝特类是最常用于治疗高血脂的化学药物,一些靶向 PCSK9 的新型治疗策略也显示出改善高血脂及相关动脉粥样硬化的前景(Wang et al., 2024)。尽管这些药物能有效改善脂质紊乱并降低血浆胆固醇水平,但其应用受到一定副作用的限制(Sobukawa et al., 2024)。因此,开发来源于天然产物的安全有效降脂化合物已成为研究热点。研究表明,食品来源的生物活性物质在改善脂质代谢和调节代谢相关功能方面具有显著潜力。例如,已从菜籽蛋白(Yang et al., 2023)、橄榄副产物(Prados et al., 2023)和小麦蛋白(Liu et al., 2021)中分离出降脂肽。此外,来自天然植物来源具有代谢调节功能的生物活性化合物也得到了系统探索,例如从忍冬属植物中鉴定出的降糖活性化合物(Wu et al., 2024)。
核桃不仅富含多不饱和脂肪酸和微量营养素,其蛋白酶解产物——核桃肽,近期因其成本低、易获取、毒性低以及在多种代谢性疾病中的功能性活性而受到广泛关注(Zhao et al., 2023)。与其他植物和谷物蛋白相比,核桃蛋白具有更好的营养和功能特性,含有较为均衡的必需氨基酸组成。此外,核桃油加工副产物富含蛋白质,已被证明是各种生物活性肽的良好来源,为核桃蛋白的高值化利用提供了基础(Liu et al., 2022)。现有研究表明,核桃肽能有效缓解高脂饮食引起的体重增加,降低血清胆固醇和甘油三酯水平,并改善载脂蛋白(Apo)-B 和 Apo-A1 的异常表达。此外,核桃肽还能调控与高血脂密切相关的关键基因(LCAT、CYP7A1、HMGR、FAS)的水平,从而发挥有效的代谢调节作用(Duan et al., 2021)。因此,进一步从核桃肽中筛选高活性降脂肽序列对于充分发挥其脂质调节潜力和实际应用价值至关重要。
生物活性肽的发现主要依赖于传统实验和虚拟筛选。尽管传统方法可靠,但耗时费力;而数据库预测和分子对接等虚拟筛选方法受限于数据库更新滞后和肽的柔性构象,制约了其实际应用(Chang, Wang, et al., 2025)。相比之下,基于机器学习的生物活性肽筛选方法能够提取肽序列、理化及结构特征,从而高效准确地从大规模肽库中鉴定潜在的功能肽(Yu et al., 2024; Zhang, Jiang, et al., 2024)。此外,与传统实验工作流程相比,基于机器学习的方法能有效降低实验过程中人为失误的风险。传统肽发现依赖于耗费人力的实验,这些常规方法容易受到人为变量的影响,包括样品制备不一致、操作人员仪器校准误差以及数据解读的主观判断,从而引入随机误差。相比之下,AI 驱动的筛选不受肽库规模限制,且无需在获得结果之前对肽进行物理合成,因此能够探索比传统方法更广泛的化学空间并有效减少实验误差(Cao et al., 2026)。在一些肽筛选过程中已取得了良好的效果。例如,AMP-Hunter 在食品来源抗菌肽筛选中达到了 95.82% 的准确率(Zhang et al., 2026);GAC-BiTCNN-AMP 模型在抗菌肽的独立测试集上也达到了 95.32% 的准确率(Ali et al., 2026)。目前,限制机器学习在生物活性肽研究中应用的主要瓶颈之一是数据问题。由于湿实验室实验成本高昂,许多研究者需要依赖 UniProt 和 DBAASP 等数据库中未标记的蛋白序列。这种模糊的标注往往缺乏代表性(Ferrell et al., 2020; Van Oort et al., 2021; Wang et al., 2021)。Chang 等人指出,抗肥胖肽和抗疲劳肽模型的构建受到已报道序列数量有限的显著制约(Chang, Liu, et al., 2025)。因此,有必要利用肽生成模型来扩充现有降脂肽数据,并在此基础上开发高效的降脂肽预测模型。
本研究旨在借助机器学习工具,进一步从核桃蛋白衍生肽中开发高活性降脂肽序列,从而增强核桃肽的降脂活性。最后,本研究综合采用体外实验、分子动力学模拟和细胞降脂实验对筛选出的肽进行了降脂活性评价。本工作为降脂肽的高通量筛选及核桃基功能食品的进一步开发提供了科学指导。