生育力与正常乳腺组织及乳腺癌组织全局基因表达谱的比较研究

《BMC Cancer》：No impact of parity on global gene expression levels in breast cancer tissue and normal breast tissue – a nested case-control study in the Norwegian Women and Cancer study

摘要

背景

我们此前已证明，绝经后乳腺癌发病率随生育力增加而呈线性下降，这与健康女性外周血细胞中数百个基因表达水平的变化有关。然而，在癌症患者的血细胞中并未观察到此类变化。本研究以生育力作为解释变量，对正常乳腺组织与乳腺癌组织的全局基因表达谱进行了比较分析。

方法

本研究采用了挪威女性与癌症（NOWAC）研究的数据，该项前瞻性队列研究于1991年至2007年间进行，共纳入172,000名参与者。2006年至2010年间加入NOWAC研究并接受乳腺癌诊断活检的女性被要求提供第二次活检样本用于科研目的。此外，从正在接受国家乳腺X线摄影筛查计划的NOWAC参与者中收集了正常乳腺组织样本。研究最终由279对年龄匹配的患者-对照组组成，配对匹配设计在所有实验室分析过程中均予以保持。组织基因表达差异通过Bioconductor R包limma识别，采用Illumina微阵列技术。两种组织的固有亚型均使用PAM50基因表达检测进行分类。

结果

研究发现，几乎所有基因在患者组与对照组之间均表现出显著差异表达，在11,308个基因中，有10,013个基因在FDR q值小于0.05时具有统计学意义。其中，5,768个基因表达上调，4,245个基因表达下调。然而，当将生育力（分为0个孩子、1-3个孩子、4-8个孩子）纳入模型后，仅有3个基因在乳腺癌组织中表现出显著变化，而在正常组织中未观察到任何显著变化。基因集富集分析未提供有效信息。此外，使用PAM50分类未能建立生育力与不同固有亚型之间的关联。

结论

本研究未发现与全胎次妊娠次数或生育力相关的正常乳腺组织与乳腺癌组织之间在基因表达上的显著差异。